LASSO Cox回归揭示卵巢癌耐药机制，发现8个关键预后基因

LASSO Cox回归揭示卵巢癌耐药机制，发现8个关键预后基因

近年来，随着高通量测序技术的快速发展，癌症研究已经进入了一个全新的阶段。在海量基因表达数据面前，如何有效筛选出与癌症发生发展密切相关的基因，成为研究者们面临的重要挑战。LASSO Cox回归作为一种结合了特征选择和生存分析的统计方法，正在成为破解这一难题的关键工具。近期，一项关于顺铂耐药卵巢癌的研究，再次展示了LASSO Cox回归在癌症基因研究中的强大威力。

卵巢癌是女性生殖系统中最常见的恶性肿瘤之一，而顺铂是治疗卵巢癌的一线化疗药物。然而，顺铂耐药性是导致治疗失败和患者预后不良的主要原因。为了深入探究顺铂耐药相关的基因，研究者们从GEO数据库中获取了GSE116439数据集，该数据集包含了7个未暴露于顺铂的样本和7个暴露于15000 nM顺铂24小时的样本。

研究者首先对这些样本进行了基因表达差异分析，筛选出在顺铂耐药组和对照组之间存在显著差异的基因。随后，他们应用LASSO Cox回归对这些差异基因进行进一步筛选，以识别与患者预后显著相关的基因。最终，研究者锁定了8个关键基因：VPS13B、PLGRKT、CDKAL1、TBC1D22A、TAP1、PPP3CA、CUX1和PPP1R15A。

这8个基因在顺铂耐药卵巢癌的预后评估中表现出显著的预测价值。研究者构建了一个基于这些基因的风险评估模型，并通过Kaplan-Meier生存曲线和ROC曲线对其性能进行了评估。结果显示，该模型具有良好的预测准确性。

进一步的分析揭示了这8个基因在卵巢癌治疗中的潜在价值。其中，VPS13B、TBC1D22A、PPP3CA、CUX1和PPP1R15A被确定为预后不良的标志基因，而PLGRKT、CDKAL1和TAP1则与较好的预后相关。这些发现不仅有助于理解顺铂耐药的分子机制，还为开发新的治疗靶点提供了重要线索。

研究者还通过CIBERSORTx分析，探讨了高风险组和低风险组之间免疫细胞浸润的差异。结果显示，巨噬细胞M1、CD4记忆静息T细胞、滤泡辅助T细胞和γδ T细胞在两组之间存在显著差异。这一发现提示，这些免疫细胞可能在顺铂耐药和卵巢癌进展中发挥重要作用。

为了进一步验证这些发现，研究者使用临床样本进行了RT-qPCR和Western Blot分析。结果证实，这8个关键基因在顺铂耐药卵巢癌样本中的表达确实存在显著差异，与生物信息学分析的结果一致。

LASSO Cox回归在卵巢癌研究中的成功应用，只是其在癌症研究领域众多突破中的一个缩影。例如，在膀胱癌研究中，研究者通过分析单细胞和bulk RNA测序数据，识别出与基底鳞状亚型相关的基因，并构建了具有强大预测能力的预后模型。这些发现不仅有助于理解癌症的分子异质性，还为个性化治疗策略的开发提供了重要参考。

随着精准医疗时代的到来，LASSO Cox回归等先进的统计方法将在癌症研究中发挥越来越重要的作用。通过精准识别与癌症表型相关的基因，研究者能够更深入地理解疾病机制，开发更有效的治疗靶点，最终实现个性化医疗的目标。未来，我们有理由期待，这类方法将带来更多突破性的发现，为癌症患者带来新的希望。