GraphPad Prism绘制柱状图形与统计分析
GraphPad Prism绘制柱状图形与统计分析
GraphPad Prism是一款广泛应用于生物医学领域的数据分析和绘图软件。本文将通过一个细胞活力检测数据的案例,详细介绍如何使用GraphPad Prism绘制柱状图并进行统计分析。
一、案例介绍
下图数据为某种细胞在不同浓度药物作用之后的细胞活力检测数据(范例数据为随机数据,无生物学意义)。
二、软件操作方法
- 打开Graphpad Prism软件,选择New table & graph-Column-Create创建新图表。(图1)
图1创建新图表
- 写入/导入数据(图2)。
图2数据录入
- 找到Graphs(图3),点击以上数据对应的名称,就可出现图形。
图3图形展示
选择合适的图形,图形有Individual values,Box and violin,Mean/median & error,可以选择想要的图形,这里选择Individual values中的第二个,如下图(图4);plot选择“mean with SEM”(均数加减标准误)。
图4图形选择
- 图形调整与优化:(1)调整命名,可选择删除Data1和Xtitle标题,点击Y轴重新命名。(图5)
图5图形调整命名
(2)可以利用change版块调整图片,也可以直接双击图形/坐标轴修改图片大小、颜色、X轴Y轴等信息。(图6-9)
图6图形change版块
图7图形柱子外观更改
8图形坐标轴信息更改
图9修改调整后的图形
- 数据统计分析
(1)确定数据是否符合正态分布,点击Analysis,选择Column analyses,选择Normality and Lognormality Tests,即正态性检验。(图10-11)
图10正态性检验
图11正态性检验
分析正态分布检测结果,若P>0.05时,数据符合正态分布。这里有几个检测,都满足了正态分布,可以考虑用参数检验中的One-way ANOVA检验(如果不满足,则选择非参数检验)。(图12)
图12正态性检验
(2)点击Data1,点击Analysis,选择Column analyses,选择One-way ANOVA(and nonparametric or mixed)即单因素方差分析。(图13-15)
图13单因素方差分析选择
图14单因素方差分析1
图15单因素方差分析2
观察结果,若P值>0.05,满足方差齐性。(注意,如果不符合方差齐性,需要重新在equal SDs选择Brown Forsythe and welch ANOVA test矫正,再重复进行分析)。(图16)
图16查看分析结果
(3)显著性分析结果(图17)。
图17显著性分析
- 将显著性分析结果作图(图18)。
图18显著性分析结果作图1
图19显著性分析结果作图2
本文原文来自厦门大学