一文带你搞清楚！生信分析中的火山图

一文带你搞清楚！生信分析中的火山图

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生信分析是生物医学科研人的“必修课”之一，阅读顶刊大牛们的精彩论文时，我们需要学会看懂文献中的各种生信图，以便更加直观深入地理解作者的研究思路。其中，火山图是一种常用的生信图，主要用于展示两组样本间基因表达的显著差异。本文将详细介绍火山图的定义、用途以及如何结合具体案例进行解读。

火山图的定义是：在一张图里显示了两个重要指标（Fold change/p-Value），主要用于展示两组样本间基因表达的显著差异。其用途包括差异表达可视化、筛选重要目标、观察点分布、评估数据质量以及交互式探索等。

接下来，我们以两个具体案例为例，来解读如何结合具体案例看火山图。案例解读1中，两个样本组分别是OA组和Gout组，纵坐标解读为当P=0.05时，-log10（P值）≈1.3，纵坐标越大于1.3，表示差异越显著。横坐标解读为FC全拼是Fold Change（差异倍数），当FC=1.2时，则log2（FC）≈0.26，当log2（FC）的绝对值越大于0.26，表示差异倍数越大。蓝点表示表达显著下调基因（或蛋白），红点表示表达显著上调基因（或蛋白），灰点表示表达无差异基因（或蛋白）。案例解读2中，FDR全拼是False Discovery Rate，即错误发现率，图中的虚线为FDR=0.01，实线为FDR=0.05，可以对我们关注的基因或蛋白进行颜色标注。

通过以上解读，我们可以了解到火山图的定义、用途以及如何结合具体案例进行解读。希望这篇文章能帮助大家更好地理解生信分析中的火山图，从而更好地进行生物医学科研。

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