重大突破:计算机设计人造蛋白成功对抗新冠刺突蛋白
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重大突破:计算机设计人造蛋白成功对抗新冠刺突蛋白
引用
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来源
1.
https://www.the-scientist.com/the-journey-to-a-nobel-prize-a-protein-design-and-structure-research-timeline-72256
2.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39644492/
3.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S294992832400066X
4.
https://news.asu.edu/20241014-science-and-technology-nobel-inspiration-shaping-future-protein-design
5.
https://www.ipd.uw.edu/author/admin/
近日,华盛顿大学蛋白质设计研究所的David Baker教授团队在《科学》杂志上发表了一项重大突破:他们成功设计出一种新型人造蛋白,能够有效对抗新冠病毒的刺突蛋白。这种人造蛋白通过计算机技术创建,显示出与目前已知最强效中和抗体相当的抗病毒活性。这一发现不仅为新冠治疗提供了新的可能性,也为未来应对其他病毒性疾病带来了希望。
01
刺突蛋白:病毒入侵的关键
刺突蛋白是冠状病毒表面的一种关键蛋白质,因其形状像刺突而得名。它在病毒入侵宿主细胞的过程中起着至关重要的作用:刺突蛋白通过识别并结合宿主细胞表面的受体,帮助病毒进入细胞内。例如,新冠病毒的刺突蛋白能与人体细胞上的ACE2受体结合。
02
从头设计:突破性的蛋白质工程方法
David Baker教授团队采用了一种称为"从头设计"(de novo design)的方法来创造这种新型人造蛋白。这种方法利用先进的计算机算法,从最基本的氨基酸序列开始,设计出自然界中不存在的全新蛋白质结构。
这种设计方法的优势在于:
- 灵活性:可以针对特定目标(如病毒刺突蛋白)设计最优化的结合结构
- 稳定性:通过计算预测,确保设计的蛋白质在实际环境中保持稳定
- 高效性:计算机模拟大大加快了设计和筛选过程
03
人造蛋白如何对抗刺突蛋白
研究团队设计的人造蛋白能够精确识别并结合新冠病毒的刺突蛋白,从而阻止病毒与宿主细胞的结合。这种结合的特异性和亲和力都非常高,使得人造蛋白能够有效地中和病毒,防止其感染细胞。
04
潜在应用与未来展望
这项突破具有重要的科学意义和实际应用价值:
- 新冠治疗:这种人造蛋白有望开发成新型抗病毒药物,用于治疗新冠感染
- 疫苗开发:可以作为疫苗候选物质,激发人体产生更强的免疫反应
- 广谱抗病毒药物:通过类似方法,可以设计针对其他病毒的特效药物
David Baker教授因其在蛋白质设计和结构方面的计算工作获得2024年诺贝尔化学奖,这进一步证明了其团队在蛋白质设计领域的权威性。这项最新研究不仅展示了计算蛋白质设计的强大能力,也为未来应对各种病毒性疾病提供了新的思路和工具。
随着技术的不断进步,我们有理由相信,基于计算设计的蛋白质将在未来的生物医学研究和临床应用中发挥越来越重要的作用。
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