甘薯基因组测序新突破：KASP标记助力乡村振兴

甘薯基因组测序新突破：KASP标记助力乡村振兴

引用

中华人民共和国农业部

等

11

来源

1.

http://www.moa.gov.cn/ztzl/zjyqwgz/ckzl/202412/t20241216_6467944.htm

2.

https://blog.csdn.net/yangl7/article/details/108357051

3.

https://blog.51cto.com/u_15668923/5605824

4.

http://www.goodbtk.com/newsitem/36031

5.

https://ivf.caas.cn/kypt/sjjsjk/258168.htm

6.

https://journal.scau.edu.cn/cn/article/id/9af3c4be-00d6-45ce-9e6c-c198a8bdb0fa

7.

https://cab.cau.edu.cn/art/2017/10/23/art_48172_950983.html

8.

https://static.nfnews.com/content/202412/13/c10335149.html?enterColumnId=74

9.

http://kdd.epsnet.com.cn/perio?urlstream=u&keyword=%E8%B0%B7%E5%AD%90%E5%88%86%E8%98%96%E7%9B%B8%E5%85%B3QTL%E5%AE%9A%E4%BD%8D%E5%8F%8A%E7%B4%A7%E5%AF%86%E8%BF%9E%E9%94%81%E6%A0%87%E8%AE%B0%E5%BC%80%E5%8F%91

10.

https://agri.nais.net.cn/literature/casdd/45E5DECA-FD4C-45A0-A237-958C83519054.html

11.

https://gdnykx.gdaas.cn/cn/article/id/dd5edfae-ddba-4c25-bd52-9c7bcc54be13

甘薯（学名：Ipomoea batatas）是世界上重要的粮食作物，其基因组测序研究近年来取得重要突破。2024年12月，中国科学家团队发布了甘薯无间隙基因组，并建立了高效的遗传转化及基因编辑系统。这一突破为甘薯的遗传改良和分子育种提供了重要基础。

在甘薯基因组测序研究中，一种名为KASP（竞争性等位基因特异性PCR）的标记技术发挥了重要作用。KASP技术可以在广泛的基因组DNA样本中，对SNPs（单核苷酸多态性）和InDels（插入/缺失变异）进行精准检测。其核心优势在于：

1. 高灵敏度：能检测个位pg级数浓度的样本
2. 快速高效：1.5小时即可完成扩增并即时出结果
3. 防止污染：PCR产物保持永久闭管状态
4. 适用范围广：可用于性状基因的精细定位、分子辅助育种、种子资源鉴定等

在甘薯研究中，KASP标记技术的应用主要体现在以下几个方面：

1. 遗传多样性研究：通过检测SNP位点，可以揭示不同甘薯品种间的遗传差异，为种质资源的保护和利用提供依据。

2. 分子育种：KASP标记可以与重要农艺性状（如产量、品质、抗病性等）关联，用于分子标记辅助选择（MAS），从而加速育种进程。

3. 品种鉴定：KASP标记可以用于区分不同甘薯品种，解决品种混杂和同名异物等问题，为种子市场监管提供技术支持。

4. 功能基因研究：结合CRISPR-Cas9等基因编辑技术，KASP标记可以帮助定位和验证功能基因，推动基础研究进展。

KASP标记技术在乡村振兴中发挥着重要作用：

1. 提升育种效率：通过精准的分子标记辅助选择，可以快速培育出优质、高产、抗逆性强的甘薯新品种，满足农民需求。

2. 保护地方品种：KASP标记可以用于鉴定和保护地方特色品种，促进农业生物多样性。

3. 优化种植管理：通过基因型与表型的关联分析，可以为农民提供科学的种植建议，提高生产效益。

4. 促进产业升级：结合区块链等技术，KASP标记可以用于建立品种权保护体系，推动甘薯产业健康发展。

展望未来，随着甘薯基因组测序技术的不断发展，KASP标记将在以下几个方面取得新的突破：

1. 高通量检测：开发更高效的检测平台，实现大规模样本的快速分析。

2. 多组学整合：结合转录组、代谢组等多组学数据，深入解析甘薯性状形成的分子机制。

3. 智能育种：利用人工智能和大数据技术，优化育种决策，实现精准育种。

4. 国际协作：加强与美国、日本、韩国等国家的合作，共享数据资源，推动全球甘薯研究发展。

总之，KASP标记技术作为甘薯基因组测序研究的重要工具，不仅推动了基础科学研究的进步，更为乡村振兴提供了有力的技术支撑。随着技术的不断完善和应用领域的拓展，KASP标记将在未来发挥更加重要的作用。