DrugBank数据库：如何查询药物靶点

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@小白创作中心

DrugBank数据库：如何查询药物靶点

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https://www.bilibili.com/opus/936176568481349673

DrugBank数据库是一个综合性的药物数据库，由加拿大阿尔伯塔大学的David Wishart博士于2006年创立。该数据库提供详细的药物信息，包括化学结构、药物靶点、代谢途径等，是药物研发和生物医学研究的重要工具。本文将详细介绍DrugBank数据库的功能、数据内容以及如何查询药物靶点。

DrugBank数据库的主要功能

DrugBank数据库有两个主要辅助角色：

临床导向的药品知识。DrugBank提供关于药品靶点和药物作用的生物或生理结果的详细、最新、定量分析或分子量的信息。
化学导向的药品数据库。提供计算机检索药物、药物“复原”、计算机检索药物结构数据、药物对接或筛选、药物代谢预测、药物靶点预测功能。

DrugBank数据库的历史与发展

DrugBank，一个综合性的药物数据库，由加拿大阿尔伯塔大学的David Wishart博士于2006年在实验室中创立。起初，DrugBank旨在为学术研究人员提供药物的详细结构化信息。2011年，DrugBank成为代谢组学创新中心（TMIC）的一部分，并在2015年分拆为OMx Personal Health Analytics Inc.。DrugBank项目得到了加拿大卫生研究院、Alberta Innovates - Health Solutions以及TMIC的资助。TMIC是由Genome Alberta、Genome British Columbia和Genome Canada共同资助的非营利组织，致力于推动加拿大的基因组学研究。

图源：drugbank

DrugBank数据库的历史版本

DrugBank自2006年发布第一个版本以来，已经经历了多次更新和扩展。第一个版本包含了841种FDA批准的小分子药物和113种生物技术药物的信息，以及2133个药物靶点。随后的版本不断增加新的药物、靶点和数据类型，如撤回药物、非法药物、食物-药物和药物-药物相互作用以及ADMET参数等。DrugBank Online的最新版本（5.1.12，发布于2024年3月14日）包含了16,618个药物条目，其中包括2,780种已获批准的小分子药物、1,626种已获批准的生物制剂、135种保健食品以及超过6,723种实验性药物。此外，5,294个非冗余蛋白质序列与这些药物条目相关联。每个条目包含200多个数据字段，覆盖药物/化学数据和药物靶标或蛋白质数据。

图源：drugbank

DrugBank数据库的开源与下载

DrugBank数据库是一个免费的在线资源，由阿尔伯塔大学和TMIC创建和维护。作为一个生物信息学和化学信息学资源，DrugBank结合了详细的药物数据和药物靶标信息。DrugBank Online网站向公众免费开放，但使用和重新分发内容或数据需要获得许可，学术用户可以申请免费许可，其他用户则需要付费许可。

当然除此之外，也可以通过‘药融云医药数据库’-开源的76个数据库进行免费下载，覆盖药品研发、全球上市、药品销售、市场信息、原料药情报局、中药、合理用药、生产检验、专利检索、医学文献检索、循证医药、医药交易&投融资等数据板块。