NHANES数据库使用指南：从数据下载到合并处理

NHANES数据库使用指南：从数据下载到合并处理

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https://m.douban.com/note/863195741/

NHANES（National Health and Nutrition Examination Survey）是美国疾病控制和预防中心（CDC）开展的一项重要健康与营养调查项目，旨在评估美国成人和儿童的健康和营养状况。该项目始于1960年代，自1999年起成为持续性研究计划，每年对约5000人的全国代表性样本进行调查。调查内容涵盖人口统计学、社会经济学、饮食和健康相关问题，以及医学、牙科和生理测量等，为营养和健康政策的制定提供了大量数据支持。

NHANES项目介绍

NHANES项目由医生、医疗技术人员及健康调查员组成的团队执行，参与者遵循自愿原则，将接受标准化的个人访谈和检查。调查内容包括：

• 人口统计学数据：包含测量设计变量（如权重、分层抽样和主要抽样单位）以及人口统计变量。
• 饮食数据：收集参与者的饮食摄入量数据，包括食物、饮料和膳食补充剂。
• 检查数据：通过体检和牙科检查收集的信息。
• 实验室数据：血液、尿液、头发、空气、肺结核皮肤试验以及家庭灰尘和水样本的分析结果。
• 问卷数据：通过家庭和流动考试中心访谈收集的数据。

研究的疾病和健康指标包括贫血、心血管疾病、糖尿病、环境暴露眼疾、听力损失、传染性疾病、肾脏疾病、营养、肥胖、口腔健康、骨质疏松、生育史和性行为、呼吸系统疾病（哮喘，慢性支气管炎，肺气肿）、性病、视力等。

NHANES官网介绍

NHANES官网提供了详细的数据库信息和数据下载服务。每两年为一个研究周期，数据按年份分类存储。主要数据类型包括：

• 人口数据：包含测量设计变量和人口统计变量。
• 饮食数据：记录饮食摄入量。
• 检查数据：体检和牙科检查信息。
• 实验室数据：各种生物样本的分析结果。
• 问卷数据：访谈收集的数据。

以NHANES 2017-2018人口数据为例，数据下载链接如下：

数据下载与合并

NHANES数据库的数据采用碎片化存储方式，需要按类别下载后进行整合。数据格式为XPT（SAS软件格式），可使用SAS Universal Viewer查看，或通过SUDAAN、SPSS、Stata和R软件包进行处理。以下是使用R语言进行数据下载和合并的步骤：

1. 安装R语言：访问CRAN下载并安装。

2. 安装R Studio：访问R Studio官网下载并安装。

3. 导入数据：

   library(foreign)
   demo_data <- read.xport('D:/nhanes/DEMO_J.xpt')
   

   如果遇到could not find function "read.xport"错误，可以在R Studio的Package界面搜索并安装foreign软件包。

4. 合并数据：

   library(foreign)
   demo_data <- read.xport('D:/nhanes/DEMO_J.XPT')
   blood_data <- read.xport('D:/nhanes/BPX_J.XPT')
   merge_data <- merge(demo_data, blood_data, by.x = 'SEQN', by.y = 'SEQN', all = TRUE)
   write.csv(merge_data, file = "./merge_data.csv")
   

通过上述步骤，可以将人口学信息和疾病信息等不同数据集合并为一个CSV格式的数据集，便于进一步分析处理。