Sanger测序技术平台详解
创作时间:
作者:
@小白创作中心
Sanger测序技术平台详解
引用
1
来源
1.
http://www.primbio.cn/m/jishupingtai-artic.jsp?id=9216b52ca70a445892da132ff9db6fda
Sanger测序技术是20世纪70年代中期由Fred Sanger及其同事发明的一代测序技术,以其高准确性和广泛的应用范围而著称。本文将详细介绍Sanger测序技术的基本原理、主要优点以及具体的技术服务和检测项目。
一.平台简介
一代测序技术是20世纪70年代中期由Fred Sanger及其同事首先发明。其基本原理是测序引物与单链DNA模板分子结合后,DNA聚合酶用dNTP延伸引物。每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)使之扩增,并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)使之终止。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3’-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止,终止点由反应中相应的双脱氧而定。使反应得到一组长几个至千个以上,相差一个碱基一系列片断。它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。常用的测序仪有3130、3730、3500等。
二.平台优点
- 操作简单,结果直观可见,是测序的金标准。
- 测序片段长,单个测序价格便宜。
- 速度快,大部分检测一周之内可以完成。
三.平台技术服务
- Sanger测序:适用大多数单基因病和已知突变位点验证。
- PCR-STR分析:用于动态突变类疾病的检测,如脊髓小脑共济失调,亨廷顿舞蹈症,脆性X综合征,强制性肌营养不良,肯尼迪病,微卫星不稳定性等。
- 多重连接探针扩增技术(MLPA):用于基因大片段缺失/重复检测,如DMD,SMA等。
- SNP分型:基于SNaPshot技术检测基因多态性,可以于一孔反应内检测30个以内的SNP位点多态性,位点可自由组合。是一种价廉,检测快速、灵活的中通量SNP检测方法。
四.主要检测项目
检测项目 | 应用 |
|---|---|
脊肌萎缩症(SMA) | 大片段缺失/重复检测(基于MLPA技术) |
天使人综合征 | |
肝豆状核变性 | |
肾上腺增生症 | |
神经纤维瘤 | |
苯丙酮尿症 | |
结节硬化症检测 | |
假肥大型肌营养不良(DMD) | |
微卫星不稳定(MSI) | 动态突变检测(基于PCR-STR技术) |
脊髓小脑性共济失调(SCAs) | |
脆X染色体综合征(FX) | |
亨廷顿舞蹈症(HD) | |
齿状核红核苍白球路易体萎缩症(DRPLA) | |
弗里德里希综合征(FRDA) | |
肯尼迪综合征(SBMA) | |
强直性肌营养不良(DM)检测 | |
1P19Q LOH | |
CYP2D6*10基因多态性 | 他莫昔芬 |
CYP19A1基因多态性 | 来曲唑/阿拉曲唑 |
ERCC1基因多态性 | 铂类(卡铂/顺铂/奥沙利铂) |
ERCC2基因多态性 | |
GSTP1基因多态性 | |
GSTM1(+/-)基因多态性 | |
XRCC1基因多态性 | |
Cyp2c8*3基因多态性 | 紫杉醇/长春碱类 |
MDR1基因多态性 | |
TYMS基因多态性 | 氟尿嘧啶/卡培他滨 |
DPYD*2A基因多态性 | |
DPYD*5A基因多态性 | |
DPYD*9A基因多态性 | |
MTHFR基因多态性 | |
RRM1基因多态性 | 吉西他滨 |
CDA基因多态性 | |
MTHFR基因多态性 | 甲氨蝶呤 |
DHFR基因多态性 | |
TYMS基因多态性 | 培美曲塞 |
UGT1A1*6基因多态性 | 伊立替康/托泊替康 |
UGT1A1*28基因多态性 | |
CYP3A4*4基因多态性 | 依托泊苷/替尼泊苷 |
CYP2C9*3基因多态性 | 环磷酰胺 |
CYP2C19*2基因多态性 | |
NQO1基因多态性 | 丝裂霉素 |
GSTP1基因多态性 | 蒽环类 多柔比星/表柔比星 |
GSTM1(+/-)基因多态性 | |
GSTT(+/-)基因多态性 | |
MDR1基因多态性 | |
SNP分型检测 | 基于SNaPshot技术 |
热门推荐
一文详解国际快递的首重与续重(国际快递干货知识分享)
科技圈的残酷真相:Deepseek一夜成名 Intel却悄无声息了
清汤面的家常做法及健康搭配建议
苔藓植物的生态功能与结构特点解析
大一萌新看过来,“这样”学C++,让你不再迷茫!
7家企业人员、薪酬对比:比亚迪招人多、广汽涨薪高、宁王待遇好
理发学校怎么选?这份指南帮你避开坑
如何确认电视是否支持Miracast协议?
走进原始部落-神奇的翁丁村
手机收不到验证码短信?试试这8个解决方案
柳宗元笔下的柳州:从古至今的风土人情
如何系统学习机器学习?
教你辨别真假花椒,这些选购技巧请收好
足球靴的历史:从古代传说到现代竞争的发展历程
探寻道家思想的本质:道与德的奥秘
太阳镜的分类与镜片特性
抗核抗体1:80、1:100、1:1000,阳性就是结缔组织病吗?
羊奶果种植几年才会结果,羊奶果适合在什么地方,什么时间种植?
羊奶果种植技术全解析:从育苗到结果的全过程
巴布亚新几内亚发现九种新蜗牛物种
探索可视化叙事逻辑:如何以视觉化方式表达故事逻辑
拖地去除甲醛的方法
地面脏污如何进行处理清洁?这种处理有哪些清洁方法?
电磁阀的流量系数对系统的流量控制有怎样的具体影响?
肝郁气滞湿热体质的调理方法
开源项目管理系统改造:7步实现信创环境兼容方案
孕妇与笋的“美味邂逅”:营养、选择与烹饪全攻略
天使鱼养殖指南:环境、饲料与成长的关键要点
中国空中交通管理行业深度分析报告
干姜的功效与使用指南