VAT1基因特征:首都医科大学为胶质瘤治疗开辟新路径
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VAT1基因特征:首都医科大学为胶质瘤治疗开辟新路径
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澎湃
1.
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放疗是胶质瘤术后重要的辅助治疗手段。然而,放射抵抗严重影响了治疗效果。全面挖掘胶质瘤的放射抗性特征十分必要。
2025年2月8日,首都医科大学附属北京天坛医院的研究团队在期刊《Heliyon》上发表了题为“A VAT1-related gene signature predicts radioresistance in gliomas”的研究论文。这项研究建立了5种基因特征,可以有效预测接受术后放疗的胶质瘤患者的生存率。免疫抑制性微环境是胶质瘤的一个特征,可能导致放射抵抗。
VAT1与胶质瘤
定位于细胞质和线粒体的囊泡氨基转运蛋白 1(VAT1)被认为是胶质瘤患者的潜在预后因素。基因肿瘤学注释标明,VAT1具有氧化还原酶活性,可调节线粒体融合。在团队之前的研究中,VAT1的正相关基因在功能上参与了免疫反应、氧化还原过程和缺氧反应。此外,团队曾发现VAT1的表达与一些免疫检查点呈正相关,并在体外实验中得到验证,表明VAT1在胶质瘤中具有免疫抑制功能。鉴于上述原因,团队利用转录数据集筛选出了VAT1相关的耐放疗特征,以全面探讨VAT1与胶质瘤放疗的相互作用,并进一步挖掘其临床价值。
5个基因的功能和蛋白表达
5个基因的注释表明,其功能主要涉及介导蛋白结合和发挥酶活性。聚类结果显示,5个基因的表达随风险评分、肿瘤分级和IDH状态而变化。从HPA数据库下载的免疫组化结果,显示了4个基因在不同患者中的蛋白表达水平。网站上没有TXNDC12对应的蛋白质信息。蛋白质表达水平分为低、中、高,柱状图显示,高级别胶质瘤(HPA数据库中提到的WHO 3级和4级)患者中特征基因蛋白质高表达水平的比例较大。根据RNA测序数据,等级越高,风险评分越高。
总结
- VAT1相关基因特征:
- VAT1高表达与肿瘤免疫抑制微环境的生成有关;
- 研究建立了与VAT1相关的5个基因特征,用于预测接受放疗的胶质瘤患者的预后;
- K-M生存分析和ROC曲线显示,这5个基因对总生存期(OS)有显著影响,风险评分可稳健预测1至5年的OS;
- 多变量Cox回归分析表明,5个基因特征是独立的预后因素;
- 高风险评分组的免疫反应更活跃,免疫细胞浸润和免疫检查点表达与风险评分呈正相关,表明存在强烈的免疫抑制效应。
- 关键基因的功能:
- Taxilinα(TXLNA):高表达预示胶质母细胞瘤(GBM)的不良预后;
- DDOST:与胶质瘤的免疫抑制微环境有关;
- GNG5:与肿瘤细胞增殖和迁移有关;
- TXNDC12:在胶质瘤中高表达,与免疫细胞浸润呈正相关;
- ARAP3:在中性粒细胞中高表达,调控整合素失活和中性粒细胞的募集和功能。
- 临床意义:
- 高危评分患者可能需要更早、更大剂量的放疗,或放疗与其他策略相结合,以提高治疗效果。
本文原文来自转化医学网
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