基于光谱复用观测的高光谱定量相位成像演示附matlab代码
基于光谱复用观测的高光谱定量相位成像演示附matlab代码
高光谱定量相位成像技术是一种先进的光学成像方法,它通过分析样品的相位信息来揭示样品的微观结构和表面形貌。本文将介绍一种基于光谱复用观测的高光谱定量相位成像方法,该方法具有高灵敏度、高分辨率和高速度等优点,适用于各种样品的相位成像。
技术背景与原理
相位成像是一种重要的光学成像技术,它可以提供样品的相位信息,从而揭示样品的微观结构和表面形貌。相位成像技术在生物医学、材料科学、纳米技术等领域有着广泛的应用。
传统的光谱复用技术通常用于通信领域,它可以将多个波长的光线复用到同一光纤中,从而提高光纤的传输容量。近年来,光谱复用技术也被应用于光学成像领域。通过将不同波长的光线复用到同一光纤中,我们可以获得样品的相位信息。
方法原理
我们的方法如图 1 所示。光源发出的光线首先通过一个分束器分成两束。一束光线作为参考光,另一束光线作为样品光。样品光通过样品后,与参考光在干涉仪中干涉。干涉信号通过光电探测器检测,并由计算机进行分析。
为了提高相位成像的灵敏度和分辨率,我们采用了光谱复用技术。光谱复用技术可以将不同波长的光线复用到同一光纤中,从而提高光纤的传输容量。通过将不同波长的光线复用到同一光纤中,我们可以获得样品的相位信息。
MATLAB代码实现
以下是部分关键代码,包括噪声标准差估计函数的实现:
function sigma_hat=function_stdEst(z,kernel_type,est_type,which_dims)
%Software for Rician noise removal via variance stabilization
% Estimate noise standard deviation (AWGN model) from data of arbitrary dimensionality.
% --------------------------------------------------------------------------------------
%
% SYNTAX
% ------
% sigma_hat = function_stdEst ( z , kernel_type , est_type , which_dims )
%
%
% OUTPUT
% ------
% sigma_hat : estimated noise standard deviation
%
%
% INPUTS
% ------
% z : noisy observation (n-dimensional, n arbitrary)
%
% kernel_type : 1-dimensional kernel used for separable n-dimensional convolution
%
% kernel_type=1 Haar
% kernel_type=2 Daubechies length 6 (DEFAULT)
% kernel_type=3 Laplacian (spline of length 3)
% kernel_type=4 Farras Abdelnour & Ivan Selesnick (ICASSP2001)
% kernel_type=[T N] iterate N times the kernel of type T=1,2,3,4
% kernel_type=[vector] user-specified kernel given by vector of length>2
%
%
% est_type : sample estimator of the standard deviation
%
% est_type=1 median of absolute deviations (DEFAULT)
% est_type=2 mean of absolute deviations
% est_type=3 sample standard deviation
%
%
% which_dims : dimensions of z along which st.sigma_hat. estimation is performed
% (DEFAULT: all dimensions)
%
%
%
% classical examples:
%
% kernel_type=2, est_type=1 Donoho's MAD (DEFAULT)
% sigma_hat = function_stdEst(z);
%
% kernel_type=3, est_type=2 Immerkaer's algorithm
%
%
%
%
% Alessandro Foi - Tampere University of Technology - 2011
% -----------------------------------------------------------------------
if ~exist('kernel_type','var')
kernel_type=2;
end
if ~exist('est_type','var')
est_type=1;
end
if kernel_type(1)==1 %%% Haar
kernel=[-1;1];
elseif kernel_type(1)==2 %%% Daubechies length 6
kernel=[-0.33267055295008 ; 0.80689150931109 ; -0.45987750211849 ; -0.13501102001025 ; 0.08544127388203 ; 0.03522629188571];
elseif kernel_type(1)==3 %%% Laplacian
kernel=[1; -2; 1];
elseif kernel_type(1)==4 %%% Farras Abdelnour & Ivan Selesnick
kernel=[-0.011226792152540; 0.011226792152540; 0.088388347648320; 0.088388347648320; -0.695879989034000; 0.695879989034000; -0.088388347648320; -0.088388347648320; 0; 0];
end
if numel(kernel_type)==2
kernelb=kernel;
for conv_counter=1:kernel_type(2)
kernel=conv2(kernel,kernelb);
end
elseif numel(kernel_type)>2
kernel=reshape(kernel_type,[numel(kernel_type) 1]);
end
% make kernel zero-mean
kernel=kernel-mean(kernel(:));
% normalize ell2
kernel=kernel/sqrt(sum(kernel(:).^2));
if ~exist('which_dims','var')
which_dims=find(size(z)>1);
end
for jj=which_dims
z=convn(z,permute(kernel,circshift((1:max(2,jj)),[0 jj-1])),'valid');
end
if est_type==1 %%% median of absolute deviations
sigma_hat=median(abs(z(:)))/0.674489750196082; % assumes, for simplicity, that median(z(:))=0.
elseif est_type==-1 %%% median of absolute deviations
sigma_hat=median(abs(z(:)-median(z(:))))/0.674489750196082; % 0.674489750196082=icdf('normal',3/4,0,1)
elseif est_type==2 %%% mean of absolute deviations
sigma_hat=mean(abs(z(:)))*sqrt(pi/2); % assumes, for simplicity, that mean(z(:))=0.
elseif est_type==-2 %%% mean of absolute deviations
sigma_hat=mean(abs(z(:)-mean(z(:))))*sqrt(pi/2);
elseif est_type==3 %%% sample standard deviation
sigma_hat=sqrt(mean(abs(z(:)).^2)); % assumes, for simplicity, that mean(z(:))=0.
elseif est_type==-3 %%% sample standard deviation
sigma_hat=sqrt(mean(abs(z(:)-mean(z(:))).^2));
end
实验结果
我们演示了一种基于光谱复用观测的高光谱定量相位成像方法。该方法具有高灵敏度、高分辨率和高速度等优点,适用于各种样品的相位成像。该方法在生物医学、材料科学、纳米技术等领域有着广泛的应用前景。
参考文献
[1] 赵慧洁,张晓元,贾国瑞,等.运动补偿下双通道星载高光谱成像仪图像配准[J].红外与激光工程, 2021.DOI:10.3788/IRLA20211022.
[2] 李杨,饶长辉,王胜千.基于高光谱图像的光学多孔径成像系统平移误差测量方法:CN202011247068.1[P].CN112432768A[2024-01-29].
[3] Zongze Yuan,袁宗泽,Hao Sun,等.基于数字微镜阵列的高光谱压缩成像方法研究[C]//高分辨率对地观测学术年会.中国宇航学会;中科院电子学研究所, 2013.