由浅入深，一文get肠道菌群与疾病的5种研究思路

由浅入深，一文get肠道菌群与疾病的5种研究思路

肠道菌群与人体健康密切相关，其研究已成为生命科学领域的热点。本文将为您详细介绍肠道菌群与疾病研究的五种主要思路，帮助您系统地理解这一领域的研究方法。

大量的研究证据表明，肠道微生物群与各种疾病存在密切的联系，如代谢疾病、心血管疾病、胃肠道疾病、神经系统疾病、自身免疫性疾病和皮肤病等。
然而，肠道微生物群本身并不直接影响有机体，而是通过其分泌小分子代谢物，调控靶器官中的分子途径，从而调节表型。目前，代谢组+微生物组（16S/宏基因组）已经成为了肠道菌群研究中主流的研究方法之一。

肠道菌群研究思路

根据不同的研究阶段，肠道菌群研究思路可分为以下5点：

1. 研究菌群与疾病的关联性

寻找疾病与健康组的差异菌群，设立健康对照组和疾病组，临床检测结合组学分析，确定与疾病显著相关的特定微生物。亦或是在此基础上增加疾病背景下影响肠道菌群的因素分析，如生活方式、饮食习惯、运动、生活环境等。

2. 研究菌群与疾病因果关系

确定是疾病导致菌群失调，还是菌群失调促进疾病发生。通过比较疾病不同进展期肠道菌群的构成变化，确定与疾病进展高度一致或相反的一种或几种目标菌，推测其促进或抑制了疾病的发生。

3. 验证菌群与疾病因果关系

验证是否由菌群促进了疾病的发生发展。将患者和健康人群的粪菌移植到无菌小鼠中，临床理化指标结合组学分析，观察患者菌群是否能促进小鼠疾病的发生和发展，研究小鼠菌群的改变以及菌群对其疾病的作用。

4. 验证致病菌或有益菌的功能及疾病机理研究

研究菌群对疾病发生的促进作用是多个菌共同作用的结果，还是有关键菌在起主导作用。首先确定一种或几种目标菌，利用动物实验对该菌进行验证。临床指标结合组学结果，综合分析该菌影响肠道菌群致病或改善疾病的机制。

5. 疾病干预、诊断、分型研究

研究干预手段（如饮食、药物、益生菌、粪菌移植等）对疾病的治疗效果。通过比较健康对照组、疾病组及疾病干预组菌群和代谢物组成的差异，验证干预手段是否是通过改变菌群来提高治疗效果。

通过生信和统计分析方法建立疾病预测模型，研究预测模型和传统疾病诊断方法对疾病的诊断效果，确定最佳诊断疾病的菌群/代谢物标志物。

样本选择

宏基因组/16S选择粪便或肠道内容物，代谢组则根据不同的研究目来选择样本类型。