四代基因测序技术对比
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四代基因测序技术对比
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基因测序技术经历了从第一代到第四代的快速发展,不仅显著提升了测序效率,还大幅降低了测序成本。本文将详细介绍四代基因测序技术的关键指标对比,包括原理、成本、测序通量、测序时间、精确度、读长等,并分析各代技术的优缺点和应用状况。
四代基因测序技术对比
基本信息对比
指标 | 第一代 | 第二代 | 第三代 | 第四代 |
|---|---|---|---|---|
原理 | Sanger双脱氧化测序,可逆终止 | Illumina的桥式扩增测序 | Helicos的单分子荧光测序 | Oxford的纳米孔测序 |
代表公司 | ABI的3730XL | Solexa, Roche的454 | Helicos, Pacific Biosciences的SMRT | Oxford Nanopore Technologies |
成本(百万碱基费用,美元) | 0.05-0.15 | 0.13-0.6 | 0.11-0.5 | 0.11-0.5 |
测序通量 | 0.2Mb | 400Mb-1.8T | 0.2-30Gb | 5-50Gb |
测序时间 | 1.6m | 2h-3d | 2h | 1.2-2h |
精确度 | 99.90% | 99.90% | 87% | 约90% |
平均读长 | 10000bp-15000bp | 400bp | 900bp | 50-300bp |
最大读长 | 300kb | 40000bp | - | - |
技术特点与优缺点
- 第一代技术:基于Sanger测序法,虽然精确度高,但成本较高,测序速度慢,应用较少。
- 第二代技术:以Illumina为代表,测序通量大幅提升,成本大幅降低,是目前应用最广泛的测序技术。
- 第三代技术:以Pacific Biosciences的SMRT技术为代表,读长长但准确度较低,成本居高不下。
- 第四代技术:以Oxford Nanopore Technologies为代表的纳米孔测序技术,基于电信号而非光信号,具有单分子测序、读长长(超过150kb)、测序速度快、数据实时监控等优点,但单芯片测序成本仍在几百美元以上。
历史发展与未来展望
从1980年代的凝胶电泳技术每天只能检测约10kb的基因数据,到如今每天可达千亿kb的检测量,基因测序技术的进步显著。1980年全基因组测序需要30亿美元,而到了2016年左右已降至1000美元,预计未来成本将进一步下降。
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