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四代基因测序技术对比

创作时间:
作者:
@小白创作中心

四代基因测序技术对比

引用
1
来源
1.
https://www.hangyan.co/charts/3424779697441998208

基因测序技术经历了从第一代到第四代的快速发展,不仅显著提升了测序效率,还大幅降低了测序成本。本文将详细介绍四代基因测序技术的关键指标对比,包括原理、成本、测序通量、测序时间、精确度、读长等,并分析各代技术的优缺点和应用状况。

四代基因测序技术对比

基本信息对比

指标
第一代
第二代
第三代
第四代
原理
Sanger双脱氧化测序,可逆终止
Illumina的桥式扩增测序
Helicos的单分子荧光测序
Oxford的纳米孔测序
代表公司
ABI的3730XL
Solexa, Roche的454
Helicos, Pacific Biosciences的SMRT
Oxford Nanopore Technologies
成本(百万碱基费用,美元)
0.05-0.15
0.13-0.6
0.11-0.5
0.11-0.5
测序通量
0.2Mb
400Mb-1.8T
0.2-30Gb
5-50Gb
测序时间
1.6m
2h-3d
2h
1.2-2h
精确度
99.90%
99.90%
87%
约90%
平均读长
10000bp-15000bp
400bp
900bp
50-300bp
最大读长
300kb
40000bp
-
-

技术特点与优缺点

  • 第一代技术:基于Sanger测序法,虽然精确度高,但成本较高,测序速度慢,应用较少。
  • 第二代技术:以Illumina为代表,测序通量大幅提升,成本大幅降低,是目前应用最广泛的测序技术。
  • 第三代技术:以Pacific Biosciences的SMRT技术为代表,读长长但准确度较低,成本居高不下。
  • 第四代技术:以Oxford Nanopore Technologies为代表的纳米孔测序技术,基于电信号而非光信号,具有单分子测序、读长长(超过150kb)、测序速度快、数据实时监控等优点,但单芯片测序成本仍在几百美元以上。

历史发展与未来展望

从1980年代的凝胶电泳技术每天只能检测约10kb的基因数据,到如今每天可达千亿kb的检测量,基因测序技术的进步显著。1980年全基因组测序需要30亿美元,而到了2016年左右已降至1000美元,预计未来成本将进一步下降。

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