揭秘:如何选择最佳血液DNA提取试剂盒?
揭秘:如何选择最佳血液DNA提取试剂盒?
在生物实验中,从血液中提取DNA是一项基础且重要的技术。选择合适的血液DNA提取试剂盒对于确保实验结果的准确性和可靠性至关重要。本文将从DNA得率、DNA纯度和价格三个方面,为您详细介绍如何选择最佳的血液DNA提取试剂盒。
血液,即医学上所称的外周血,是DNA提取的重要来源。从外周血中提取DNA,实质上是从有核的白细胞中分离并纯化DNA的过程。当前主流的方法涉及血细胞的裂解以释放DNA,随后在高盐条件下促使DNA从有机溶剂中沉淀析出,并最终通过去除蛋白质、色素和盐分等杂质以获得高纯度的DNA。为获取高质量的血液DNA,选择适宜的血液DNA提取试剂盒至关重要,这一过程需考虑以下几个关键因素:
DNA得率考量
DNA得率直接关联于裂解液的性能表现。裂解液通常包含去污剂、盐类和蛋白酶等成分。去污剂通过导致蛋白质变性、破坏膜结构以及解除与核酸结合的蛋白质,从而使核酸游离于裂解体系中。盐类则为反应创造了一个适宜的裂解环境,有效抑制样品中核酸酶对核酸的破坏作用,同时维持核酸结构的稳定性。蛋白酶则负责将蛋白质分解为小分子片段,促进核酸与蛋白质的分离。性能卓越的裂解液能够高效地破坏细胞膜结构,确保DNA的充分释放;反之,则可能导致DNA得率显著降低。
在国内常用的血液DNA提取试剂中,如Qiagen与Starvio等品牌,其裂解液性能表现尤为出色,通常仅需加入血液后10分钟即可实现血细胞的完全裂解。此外,DNA得率与血液样品的体积呈正相关。如需提高DNA得率,可通过增加血液样品的量来实现。一般而言,初始提取量设定为200微升的全血,若结果未达预期,则可考虑增加血液样品量。然而,若增加血液量后仍无法获得满意结果,则应及时考虑更换提取试剂。在国内市场,Qiagen与Starvio等品牌广受认可。据经验数据显示,Qiagen试剂的血液DNA提取得率约为每毫升样本15至20微克;而Starvio的提取得率与Qiagen相近,每毫升血液样本的DNA得率在11至42微克之间,均能满足下游PCR实验的需求。
DNA纯度的重要性
DNA的纯度对于后续的PCR、荧光定量PCR及各种酶切实验等具有至关重要的影响。通常,通过测定OD260/OD280比值来评估核酸的纯度。纯DNA的OD260/OD280比值应为1.8。若提取的DNA溶液OD260/OD280比值低于1.6,则可能表明存在蛋白质、酚类或多糖等污染。反之,若OD260/OD280比值超过1.9,则可能意味着存在RNA污染。
DNA纯度受到吸附膜对DNA的亲和力以及洗涤液性能的共同影响。吸附膜对DNA的亲和力越强,以及洗涤液去除蛋白质、色素、盐分和多糖等污染物的能力越强,则所得DNA的纯度越高。当前市场上的血液DNA提取试剂所采用的吸附膜分为国产与进口两类。国产吸附膜在吸附DNA方面的能力相对较弱。值得注意的是,Starvio等品牌采用的是进口的化学修饰离子膜,相较于传统的核酸吸附膜更为薄透,但亲和力却更为强大,能够高效且专一地吸附DNA。同时,包括Starvio、T品牌以及国外的Qiagen等品牌在内的洗涤液均表现出色,能够最大限度地去除血液中的血红蛋白、脂类和盐分等杂质。在实验过程中,所提取的DNA溶液OD260/OD280比值维持在1.7至1.9之间,利用这些DNA进行后续的PCR、荧光定量PCR及各种酶切实验等均未出现问题。
试剂价格的考量
价格同样是选择产品时不可忽视的重要因素。对于绝大多数实验项目,如PCR、qPCR、基因检测及分子杂交等,国产试剂在质量上均能满足要求。与国外知名品牌相比,国产试剂在价格上更具优势。例如,Starvio等品牌的价格还不到国外品牌价格的30%,具有较高的性价比。因此,对于上述实验项目,建议优先考虑选用Starvio等国产试剂。
综上所述,与国外知名品牌相比,国产试剂在血液DNA提取的纯度和得率方面相差无几,但在价格方面却展现出显著优势。对于经费有限或需进行PCR、qPCR及分子杂交等实验的用户而言,可考虑选择性价比更高的Starvio等国产品牌。