揭示胆盐水解酶催化胺结合胆汁酸的形成机制
揭示胆盐水解酶催化胺结合胆汁酸的形成机制
近日,美国宾夕法尼亚州立大学的Andrew Patterson教授团队在Nature期刊上发表重要研究成果,揭示了胆盐水解酶(BSH)催化形成胺结合胆汁酸(BBAA)的机制。这一发现不仅深化了我们对肠道微生物调节胆汁酸代谢网络的理解,还为相关疾病的治疗提供了新的思路。
研究背景
- 近期研究表明,胃肠道中的细菌能够合成氨基酸胆汁酸酰胺酸酯,其能够影响宿主介导的代谢过程。然而,负责这些偶联反应的酶及其对应的细菌基因目前尚未被明确鉴定。
- 细菌胆汁酸酰胺酸酯(BBAA)在胃肠道中广泛存在,并且与人类炎症性肠病的发生发展密切相关,但这一过程对宿主—微生物群通讯的具体影响机制尚不明确。
研究结果
蛋白质-小分子相互作用
研究团队总结先前相关报道以确定负责产生BBAA的可能候选基因,发现其中胆汁盐水解酶(BSH)基因与BBAA的产生显著相关,这种关联体现在双歧杆菌属和肠球菌属中,两种菌属广泛携带bsh基因以产生BBAA。
为深入探究bsh及其他基因在胆汁酸偶联中的作用,对产生BBAA的长双歧杆菌菌株进行转录组测序,共计鉴定筛选出89个差异表达基因,其中bsh基因显著上调,随后RT-qPCR同样证实了bsh的转录水平显著增加。已知bsh的表达响应于胺结合和非胺结合胆汁酸的混合物而上调,因此推测BSH或具有以未结合胆汁酸为底物的胺N-酰基转移酶活性的可能性。
BSH是一种细菌的N-酰基转移酶
选用BSH抑制剂GR-7抑制经胆酸(CA)及去氧胆酸(DCA)处理的长芽孢杆菌所产生的BSH活性。通过靶向定量代谢分析可知,与载体处理的对照组相比,添加GR-7可使BBAA水平显著降低,尤其是苯丙氨酸和丙氨酸偶联物。
培养bsh缺失(Δbsh)的脆弱拟杆菌菌株,经CA或牛磺胆酸(TCA)处理后,bsh的缺失可阻止CA和TCA诱导的BBAA产生,而互补可恢复BBAA的产生,Δbsh定植小鼠结果亦是如此,这表明BSH具有胺N-酰基转移酶活性。随后将长芽孢杆菌中的bsh基因克隆到pET-28b(+)载体(BlBSH)中,并在大肠杆菌中过表达。将大肠杆菌-BlBSH与CA或TCA孵育可产生BBAA,而未转化的大肠杆菌则不产生BBAA,这表明BSH的存在足以生产BBAA。对BlBSH活性位点附近的9个残基进行定点诱变,发现BSH的N-酰基转移酶活性与每个突变的解偶联活性密切相关。
BBAA水平与微生物群发育相吻合
对从出生到12个月的婴儿粪便进行宏基因组测序,结果显示拟杆菌种群丰度随发育进展逐渐升高,而双歧杆菌的相对丰度降低。靶向定量代谢分析结果表明BBAAs的水平也逐渐升高。在12个月大的婴儿中,肠球菌丰度与宿主结合的胆汁酸和BBAAs(包括Ala、Ile/Leu、Phe、Ser和Tyr)呈正相关。在1个月大的婴儿中,双歧杆菌丰度与宿主结合的胆汁酸呈负相关,与His和Thr的胆汁酸结合呈正相关。这些数据支持了BBAA的产生与表达bsh的细菌的定植呈正相关。
BBAA可激活宿主转录因子
采用Glu-CA或Glu-CDCA处理从小鼠和人小肠隐窝培养的类器官,荧光素酶报告基因分析显示,在小鼠类器官中的Cyp3a11、Cyp1a1和Bsep表达上调,表明孕烷X受体(PXR)和芳基烃受体(AHR)被转录激活。用较高浓度的Glu-CDCA处理后的人类类器官中的AHR受体中的CYP1A1表达也上调,揭示了BBAAs可激活宿主转录因子。
研究结论
本研究综合运用靶向定量代谢物、转录组测序、宏基因组测序、菌株培养、粪菌定植等多种方法,创新性地发现胆盐水解酶(BSH)具有N-酰基转移酶活性,能够形成细菌胆汁酸酰胺酸酯(BBAA),并与肠道细菌的定植呈正相关。本研究结果有助于加深对肠道细菌通过BSH在调节胆汁酸代谢网络中发挥重要作用的理解。
本文原文来自univ-bio.com