Nature子刊:基于驱动突变的儿童AML新分子病理分型和风险模型
Nature子刊:基于驱动突变的儿童AML新分子病理分型和风险模型
近日,美国圣裘德儿童研究医院的研究团队在《自然·遗传学》(Nature Genetics)发表重要研究成果,提出了一种基于驱动突变的儿童急性髓系白血病(AML)分子病理分型和风险模型。这一突破性进展有望为儿童AML的精准治疗提供新的方向。
研究背景与意义
儿童AML是儿童时期发病率第二位的白血病,尽管近年来生存率有所提高,但仍低于儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)。目前,成人AML已有基于详细突变分析的风险分层系统,而儿童AML由于其特殊的变异图谱和病例数量较少,缺乏有效的分子分型策略。
研究方法与发现
研究团队收集了887个独立样本(包括783例初诊和104例复发患者),对所有样本进行了全RNA测序和分析,涵盖了融合基因、串联重复序列、拷贝数变异、单核苷酸变异和插入缺失位点等多种类型的数据。研究发现:
- 在887个病例中,627例发现了致病融合基因或结构变异位点,共识别出1924个致病或疑似致病变异。
- 根据现行WHO分型系统,仅68.5%的病例能够被成功分类,远低于成人AML的95%。
- 研究团队开发了一个新的分类系统,通过结合基因变异和基因表达图谱,将儿童AML分为23个分子类别,覆盖了整个队列的91.4%。
儿童AML队列(n = 887)和正常脐带血细胞(n = 5) UMAP 图。不同颜色的点代表不同的分子分型。
新分类系统的创新性
新分类系统不仅涵盖了WHO分类中的主要亚型,还特别关注了儿童AML中常见的KMT2A或NUP98重排亚型,以及成人和儿童共有的RUNX1::RUNX1T1融合等亚型。研究进一步发现,根据HOXA和HOXB的表达量,可以将分子分型分为两组,这两组在其他基因变异图谱上表现出相似性,但FLT3和WT1中的变异类型存在差异。
风险预测模型
研究团队结合临床数据,将患者分为高、中、低三个风险组,并发现这一分层系统能够有效预测患者的生存率。当与微小残留病变(MRD)检测结果相结合时,预测的准确性进一步提高。
不同风险组的总生存率(OS)对比
未来展望
这项研究为建立儿童AML的分子分型系统和风险分层标准提供了重要参考,但研究者也指出,基于回顾性研究的性质,目前还无法为临床治疗方案的选择提供直接证据。未来需要更多前瞻性研究来验证和完善这一分类系统,特别是关于造血干细胞移植在不同分子分型中的应用价值。
这项研究不仅建立了首个专门针对儿童AML的分子分型数据库,还提出了基于驱动突变的分子病理分型和风险模型,为儿童AML的精准治疗和药物开发提供了新的理论依据。