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华大智造助力MNP技术,为种子办“身份证”

创作时间:
作者:
@小白创作中心

华大智造助力MNP技术,为种子办“身份证”

引用
中华人民共和国农业部
12
来源
1.
http://www.moa.gov.cn/xw/qg/202203/t20220317_6392701.htm
2.
https://baike.baidu.com/item/%E6%A4%8D%E7%89%A9%E5%93%81%E7%A7%8D%E9%89%B4%E5%AE%9A%E2%80%94MNP%E6%A0%87%E8%AE%B0%E6%B3%95/53650356
3.
http://down.foodmate.net/standard/sort/3/72965.html
4.
https://www.ndls.org.cn/standard/detail/0fa359533ef8462bb2305c344862cf50
5.
https://mgi-tech.com/news/857/
6.
https://www.mgi-tech.com/News/caseinfo/id/60
7.
https://www.mgitech.cn/product/detail/MGIFLP.html
8.
https://www.mgitech.cn/products/instruments_info/20/
9.
https://www.casb.org.cn/CN/10.11924/j.issn.1000-6850.2013-1718
10.
https://www.gov.cn/yaowen/liebiao/202407/content_6962551.htm
11.
https://nongxue.hebau.edu.cn/info/1132/2097.htm
12.
https://snw.yancheng.gov.cn/art/2021/2/2/art_24595_3483534.html

近年来,随着新《种子法》的实施,中国种业原始创新成为焦点。由江汉大学生物基因检测鉴定中心负责人彭海教授及其团队研发的MNP标记法,依托国产平台华大智造测序仪,成功解决了种子知识产权保护难题。该方法通过高通量测序技术,一次性可检测多达上千个标记位点,为种子构建精准的DNA指纹,相当于给每个品种颁发了独一无二的“身份证”。这一技术不仅提高了品种真实性鉴定的效率和准确性,还推动了种业市场的净化,助力打好种业翻身仗。

01

MNP技术:突破传统检测瓶颈

MNP标记法(多核苷酸多态性标记法)是一种创新的分子鉴定技术,主要用于植物品种的鉴定。其核心优势在于能够一次性检测大量标记位点,每个标记准确率高达99.98%以上。相比传统的SSR标记法和SNP标记法,MNP标记法具有以下显著优势:

  1. 高通量检测:单次实验可检测317-1042个标记位点,而SSR标记法一次只能检测22-48个位点。
  2. 高准确性:每个标记的准确率高达99.98%,而SNP标记法的错误率为1%。
  3. 多路复用能力:通过多重PCR扩增,实现对多个靶标区域的同时检测。
  4. 标准化流程:从DNA提取、建库测序到数据分析,全程标准化操作,减少人为误差。

02

华大智造:国产测序平台的崛起

华大智造作为全球领先的基因测序设备制造商,为MNP技术提供了强大的硬件支持。其核心产品MGISEQ-2000测序仪具有以下特点:

  1. 高通量:每次运行可处理1-2张载片,支持生育检测、病原快检、肿瘤检测等多种应用场景。
  2. 高准确性:采用DNBSEQ测序技术,具有滚环复制扩增带来的低错误累积率和规则阵列芯片带来的高信号采集效率。
  3. 自动化:从反应到测序全部实现自动化、智能化,数据可直接上传云端进行分析。
  4. 国产化:全套设备和试剂实现国产化,避免了技术“卡脖子”问题。

03

种子DNA身份证:构建与应用

种子DNA身份证的构建过程主要包括以下几个步骤:

  1. DNA提取:从种子中提取纯化DNA。
  2. 多重PCR扩增:使用设计好的引物对目标区域进行扩增。
  3. 高通量测序:通过华大智造测序仪进行测序,获取MNP标记数据。
  4. 数据分析:利用贝叶斯模型计算遗传相似度,生成DNA指纹图谱。
  5. 数据库比对:将获得的DNA指纹与数据库中的数据进行比对,判断品种身份。

目前,崖州湾科技城已经合作构建完成了七千多个授权水稻品种的DNA指纹库,为种业知识产权保护提供了重要基础。通过这个数据库,可以快速准确地判断种子的知识产权归属,打击种子侵权行为,保护育种者的合法权益。

04

展望:助力种业高质量发展

MNP技术的应用前景广阔,不仅在种子知识产权保护方面发挥重要作用,还可以应用于品种真实性鉴定、实质性派生品种判定等多个领域。随着数据库的不断完善,更多“仿种子”将无处遁形,真正有价值、突破性的新品种将脱颖而出,推动我国种业向高质量、高创新的方向发展。

通过华大智造的测序平台,MNP技术正在为我国种业插上科技翅膀,助力打好种业翻身仗,为保障国家粮食安全提供强有力的技术支撑。

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