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STR分型技术:从法医鉴定到医学诊断的广阔应用

创作时间:
作者:
@小白创作中心

STR分型技术:从法医鉴定到医学诊断的广阔应用

引用
9
来源
1.
http://www.xpbiomed.com/newsitem/278361815
2.
https://www.pumch.cn/detail/32180.html
3.
https://rs.yiigle.com/cmaid/1470870
4.
http://www.microread.com/faqDetail/4-1354-14.html
5.
http://www.microread.com/newsDetail/3-1793-13.html
6.
https://www.illumina.com.cn/science/genomics-research/articles/str-expansionhunter.html
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https://ccdas.pmphai.com/appguide/toPcDetail?sessionId=&knowledgeLibPrefix=guide&id=0001AA100000000EGDRL
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https://www.abace-biology.com/STR.htm
9.
https://www1.dev-web.illumina.com.cn/techniques/popular-applications/genotyping/karyomapping.html

短串联重复序列(Short Tandem Repeats,STR)分型技术是近年来在生物医学领域备受关注的一种分子遗传学检测方法。其原理是通过分析基因组中特定位置的短串联重复序列的长度多态性,来实现个体识别、亲缘关系鉴定以及疾病诊断等目的。STR分型技术具有高度的准确性和特异性,已被广泛应用于法医学、人类遗传学研究以及临床诊断等多个领域。

STR分型技术的基本原理

STR是人类基因组中广泛存在的一类DNA序列,其特征是由2-6个碱基组成的重复单位串联而成,整个基因组平均每15kb就存在一个STR位点,目前已发现超过7000个这样的位点。由于STR位点在个体间的重复次数存在显著差异,这种长度多态性构成了其遗传标记的基础。

传统的STR分型主要采用荧光标记的PCR-毛细管电泳(PCR-CE)技术。该技术通过设计特异性引物对目标STR位点进行扩增,扩增产物经毛细管电泳分离后,根据片段迁移时间与分子量内标对比,实现等位基因的准确分型。PCR-CE技术具有分辨率高、图谱直观、易于标准化等优点,是目前国际上STR分型的金标准。

STR分型在法医领域的应用

在法医学领域,STR分型技术因其高度的个体识别能力和抗降解特性而成为主流的DNA分析方法。国际上大多数打击违法犯罪的DNA数据库都是基于STR基因座建立的。然而,传统的PCR-CE技术也存在一些局限性,例如无法检测序列内碱基的差异、对混合样本中微量成分的检测能力有限等。

新一代测序技术(Next-Generation Sequencing,NGS)的出现为STR分型带来了革命性的突破。NGS技术不仅能够精确检测DNA序列,展示STR等位基因的核心序列和侧翼序列的真实差异,还能同时获得SNP、Indel等多种遗传标记信息。这种高通量、高分辨率的检测能力使得NGS在处理复杂样本(如混合生物检材)时具有显著优势。

一个典型的案例是荷兰阿姆斯特丹的一起性侵案。在这起案件中,通过NGS技术对混合样本进行分析,成功获得了嫌疑人的DNA信息,并最终将其绳之以法。这是NGS技术首次作为证据出现在法庭上并获得诉讼成功,标志着该技术在法医领域应用的成熟。

STR分型在医学领域的潜在应用

虽然目前关于STR分型在遗传病诊断中的具体应用指南尚缺乏权威资料,但其技术特点预示着在医学领域具有广阔的应用前景。STR分型的高分辨率和准确性使其在遗传病诊断、亲缘关系鉴定、器官移植配型等领域具有潜在价值。特别是在产前诊断中,STR分型可以用于排查母源细胞污染、辅助诊断单亲二体疾病等。

然而,值得注意的是,STR分型技术在医学领域的应用仍面临一些挑战。例如,如何在复杂的临床样本中准确区分STR峰、如何处理Stutter峰等干扰因素、以及如何建立标准化的分析流程等。这些问题需要通过进一步的研究和临床实践来解决。

综上所述,STR分型技术凭借其高度的准确性和多态性,在法医学和医学领域展现出重要的应用价值。随着技术的不断进步,特别是NGS技术的引入,STR分型有望在更多领域发挥重要作用。然而,其在医学领域的具体应用仍需更多的研究和规范来指导。

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