生存分析之生存曲线
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生存分析之生存曲线
引用
CSDN
1.
https://m.blog.csdn.net/zfyyzhys/article/details/139131796
生存分析是医学研究中常用的一种统计方法,用于分析随时间变化的事件发生概率。其中,生存曲线(Survival Curve)是最常见的展示方式之一,最常用的是Kaplan-Meier曲线。本文将详细介绍生存曲线的基本概念、解读方法以及如何使用SPSS和R语言绘制生存曲线。
生存曲线的基本概念
生存曲线,最常见的就是Kaplan-Meier曲线,是一种在医学研究中常用的图表,用于描述不同组别患者的生存状况。这种曲线通常以时间为横坐标,以生存率为纵坐标,通过连接每个时间点的生存率,形成一条曲线。每一个点代表了在该时间点上的生存率,曲线的下降表示有患者死亡或发生了研究的阳性终点事件。
生存曲线的解读
- 中位生存时间:累计生存率为50%时所对应的生存时间(上图A点所对应的时间)。
- 中位随访时间:生存时间的中位数(利用反K-M法计算,将出现结局事件定义为0,再利用K-M法估计)。
- 死亡速度与生存率:死亡速度越快,生存率越低,那么生存时间越短。高风险组患者的死亡速度通常比低风险组患者快,因此生存时间较短。需要注意的是,在生存分析中,“死亡”不仅仅指生理上的死亡,也可以指其他研究关注的事件。
- 阳性事件和删失:在生存分析中,阳性事件是指研究关注的事件发生,如疾病复发、死亡等。删失(Censoring)是指在观察期间未发生阳性事件的情况,可能是由于患者失访、研究结束等原因。
- 统计检验:为了验证生存曲线之间的差异是否具有统计学意义,通常会使用log-rank检验或Cox比例风险回归模型等统计方法。P值一般保留3位小数点。
如何绘制生存曲线
使用SPSS绘制生存曲线
- 建立含有变量、生存状态、生存时间的Excel表格并导入SPSS(本例使用SPSS26版本)。
- 选择对应的参数选入,将出现阳性事件定义为1。
- 做出生存曲线图,并进行调整。
使用R语言绘制生存曲线
# 安装R包
install.packages("survival")
install.packages("survminer")
# 加载R包
library(survival)
library(survminer)
# 读取数据
data <- read.csv("Survival.CSV")
# 拟合生存模型
fit <- survfit(Surv(OS, Status) ~ Risk, data = data)
# 作图
p <- ggsurvplot(fit, data = data,
font.title = c(10, "bold", "darkblue"), # 标题字体
font.subtitle = c(11, "italic", "purple"), # 副标题字体
font.caption = c(10,"plain","orange"), # 说明字体
font.x = c(11), # x轴字体
font.y = c(12), # y轴字体
fun = "pct", risk.table = T,
risk.table.y.text.col = T,
risk.table.height = 0.25,
risk.table.y.text = FALSE, size = 0.8,
palette = c(), # 调色
legend.labs = c("high", "low"),
legend.title = "Risk",
ylab = "Overall Survival(%)",
xlab = "Time (months)",
censor.shape = 124, censor.size = 2,
conf.int = FALSE,
break.x.by = 20,
xlim = c(0, 85),
surv.median.line = "hv",
pval = T,
ggtheme = theme_classic())
# 呈现生存曲线
p
通过以上步骤,可以使用SPSS或R语言绘制出清晰的生存曲线图,帮助研究人员更好地理解数据并进行统计分析。
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