胶质瘤基因分子检测报告看不懂?请看……
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脑胶质瘤是一种常见的原发性颅内肿瘤,其发病率在全身肿瘤中仅次于胰腺癌和肺癌。随着医学技术的发展,分子检测在胶质瘤的诊断、治疗和预后评估中发挥着越来越重要的作用。本文将为您详细介绍胶质瘤分子检测的相关知识。
2021版WHO中枢神经系统肿瘤分类标准
2021年发布的5版《WHO中枢神经系统肿瘤分类》整合了肿瘤的组织学特征和分子表型,提出了新的肿瘤分类标准,重点推进了分子诊断在中枢神经系统肿瘤分类中的应用。这一分类是目前脑胶质瘤诊断及分级的重要依据。
什么是胶质瘤分子检测?
分子检测又叫生物标志物检测,是指在体内发现的某种分子,从而作为某种病症或异常的表现。在胶质瘤治疗中,生物标志物检测用于寻找基因、蛋白和其他标志物的分子变化。其中DNA的突变占据了这种变化相当重要的一部分。
胶质瘤常用分子病理学检测指标
分子标志物 | 遗传学变异 | 检测方法 | 诊断价值 | 预后意义 |
|---|---|---|---|---|
IDH1 | 突变(R132H/C/L/S/G) | 免疫组化,Sanger测序,焦磷酸测序,二代测序 | 胶质瘤分类的关键分子变异;可鉴别WHO1级胶质瘤与胶质增生。 | 提示预后相对良好;在临床试验中常作为重要分组指标;与MGMT启动子甲基化密切相关;对放疗和烷化剂相对敏感;潜在的治疗靶点(例如lvosidenib)。 |
IDH2 | 突变(R172K/M/G/W) | Sanger测序,焦磷酸测序,二代测序。 | - | 提示预后相对良好;对于放疗和烷化剂相对敏感。 |
染色体1p/19q | 联合缺失 | FISH,PCR,甲基化芯片/表达谱芯片/二代测序相关方法 | 少突胶质细胞瘤的关键变异。 | 提示预后相对良好;对于放疗和烷化剂相对敏感。 |
H3 K27 | 突变(K27M) | 免疫组化,Sanger测序,二代测序。 | 诊断弥漫性中线胶质瘤,H3K27突变型的关键参考指标。 | 预后相对较差;可作为潜在治疗靶点(例如EZH2控制剂)。 |
H3 G34 | 突变(G34R/V) | 免疫组化,Sanger测序,二代测序 | 弥漫性中线胶质瘤,H3K27突变型。 | 生存期比IDH突变型胶质母细胞瘤略长,但比IDH突变型WHO 4级胶质瘤短。 |
ATRX | 突变 | 免疫组化Sanger测序,二代测序 | ATRX核表达缺失和/或p53突变阳性,可在不检测1p19q的情况下诊断为IDH突变型是形细胞瘤。 | 相对于IDH突变型胶质母细胞瘤预后较好。 |
TP53 | 突变 | 免疫组化Sanger测序,二代测序 | ATRX核表达缺失和/或P53突变阳性,可在不检测1p19q的情况下诊断为IDH突变型星形细胞瘤,可用于鉴别弥漫或非弥漫性WHO 1级胶质瘤及胶质增生。 | - |
CDKN2A/B | 纯合性缺失 | FISH,qPCR,MLPA,甲基化芯片/表达谱芯片/二代测序相关方法 | 组织学缺少坏死和微血管增生的星形细胞瘤,IDH突变,WHO 4级胶质瘤的诊断指标之一。 | 在IDH突变型胶质瘤中预后较差。 |
TERT | 启动子突变(C228T/C250T) | Sanger测序,焦磷酸测序,二代测序 | 在少突胶质细胞瘤和胶质母细胞瘤中常见;在缺少组织学坏死和微血管增生的情况下,是胶质母细胞瘤,IDH野生型,WHO4级的诊断指标之一。 | 在IDH野生型胶质瘤中预后较差;在IDH突变型胶质瘤中预后较好。 |
染色体7/10 | +7/-10 | FISH,二代测序,微阵列芯片 | 在缺少组织学坏死和微血管增生的情况下,是胶质母细胞瘤,IDH野生型,WH04级的诊断指标之一。 | 在IDH野生型胶质瘤中预后较差。 |
EGFR | 扩增 | FISH,数字PCR,二代测序,微阵列芯片 | 星形细胞瘤,IDH突变型,WHO4级胶质瘤的诊断指标之一;胶质母细胞瘤,IDH野生型,WHO4级胶质瘤的诊断指标之一。 | - |
EGFRvIII重排 | RT-PCR,数字PCR,免疫组化MLPA,二代测序 | EGFRvIII发生在约半数EGFR扩增的胶质母细胞瘤中。 | - | 靶向治疗的潜在靶点。 |
BRAF | 突变(BRAFV600E) | 免疫组化Sanger测序,焦磷酸测序,二代测序 | 在多种胶质瘤中出现,包括表皮型胶质母细胞瘤。 | 靴向治疗的靶点(例如vemurafenib)。 |
MGMT | 启动子区甲基化 | 甲基化特异性PCR,焦磷酸测序,甲基化微阵列 | - | 在胶质母细胞瘤中预后较好;替莫唑胺治疗效果较好;与IDH突变和G-CIMP亚型相关。 |
FGFR | 融合基因(FGFR-TACC) | Sanger测序,二代测序,qPCR | 在星形细胞瘤,IDH野生型,WHO4级和胶质母细胞瘤,IDH野生型,WH04级中出现。 | 可作为靶向治疗的潜在点(例如FGFR控制剂) |
MET | 融合基因(PTPRZ1-MET)、突变(METex14) | Sanger测序,qPCR,二代测序 | 在星形细胞瘤,IDH野生型,WHO4级和胶质母细胞瘤,IDH野生型,WH04级中出现。 | 在继发性胶质母细胞瘤(星形细胞瘤,IDH突变型,WHO 4级)中预后较差;可作为治疗靶点(例如MET控制剂)。 |
miR-181d | 高表达 | microRNA表达谱芯片,qPCR,原位杂交染色。 | - | 在胶质母细胞瘤中表达较高时,对替莫唑胺化疗效果较好。 |
TSC1/2 | 突变 | Sanger测序,NGS | 诊断室管膜下巨细胞星形细胞瘤的特异性标志物。 | mTOR信号通路控制剂(如依维莫司)治疗靶点。 |
ZFTA | 基因融合(C11orf95-RELA) | FISH,NGS | 诊断C11orf95融合阳性型幕上室管膜的特异性标志物。 | 发生该融合的幕上室管膜瘤患者预后相对较差。 |
YAP1 | 基因融合(YAP1-MAMLD1) | FISH,NGS | 诊断YAP1融合阳性型幕上室管膜的特异性标志物。 | 发生该融合的幕上室管膜瘤患者预后相对较好。 |
MYCN | 扩增 | FISH,NGS | 诊断MYCN扩增型脊髓室管膜的特异性标志物。 | 发生该扩增的脊髓室管膜瘤患者预后相对较差。 |
NF1 | 突变 | Sanger测序,NGS | 在视路胶质瘤和IDH野生型胶质母细胞瘤中突变频率较高。 | 携带该突变的毛细胞型星形细胞瘤预后相对较好。 |
如何做胶质瘤分子检测?
做分子病理检测需要提供的样本主要是患者的病理组织,可以是蜡块、切成的白片或者新鲜组织。部分项目的检测方式需要患者的血液样本,具体根据检测项目来定。要注意:肿瘤组织是较佳样本,可以说是金标准。
在选择基因检测公司时,建议选择获得国家(国际)认可的实验室,特别是拥有CAP(美国病理学家协会)和CLIA双重认证的机构,以确保检测结果的准确性。
资料来源:国家卫生健康委员会医政医管局,中国抗癌协会脑胶质瘤委员会,中国医师协会脑胶质瘤委员会.脑胶质瘤咨询指南(2022版)[J].中华神经外科杂志,2022,38(08):757-777.DOI:10.3760/cma.j.cn112050-20220510-00239
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