Cell | 大连医科大学团队揭示了肠道真菌的生物多样性与临床价值

Cell | 大连医科大学团队揭示了肠道真菌的生物多样性与临床价值

大连医科大学研究团队在顶级期刊《细胞》（Cell）上发表重要研究成果，构建了一个包含760个真菌基因组的培养肠道真菌目录（CGF），这一发现不仅丰富了人类对肠道真菌多样性的认识，还揭示了肠道真菌与多种疾病的相关性。

人类的消化系统由各种各样的微生物组成，包括细菌、古细菌、病毒和真菌。与细菌群落一样，被称为肠道真菌群落的真菌群落构成了健康微生物群落的重要组成部分，并对宿主的各种过程(如特殊膳食化合物的代谢)产生影响。

模式图（Credit: Cell）

然而，人们对人类肠道菌群的遗传和功能变异的了解仍然有限。虽然已经采取了一些举措来培养肠道真菌，并从粪便宏基因组中重建真菌基因组，但这些措施只覆盖了据信栖息在健康人类肠道中的大约400种或更多真菌物种的一小部分。截至2023年6月，美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库中约有4%的真菌基因组来自人类栖息地。这些统计数据强调了人们对肠道微生物群这一重要组成部分的理解存在重大差距。

大连医科大学马骁驰、王超、中国科学院上海药物研究所果德安及北京林业大学Francis Martin共同通讯（大连医科大学为第一单位）在Cell 在线发表题为“A genomic compendium of cultivated human gut fungi characterizes the gut mycobiome and its relevance to common diseases”的研究论文，该研究提出了培养肠道真菌(CGF)目录，包括760个来自健康个体粪便的真菌基因组。该目录包括48科206种，包括69种以前未识别的物种。该研究探索了CGF物种的功能和代谢属性，并利用该目录通过分析来自中国和非中国人群的11,000多个粪便宏基因组来构建肠道菌群的系统发育表示。此外，该研究确定了肠道真菌组组成中显著的常见疾病相关变异，并通过动物实验证实了真菌特征与炎症性肠病(IBD)之间的关联。这些资源和发现极大地丰富了人们对人类肠道菌群的生物多样性和疾病相关性的理解。

这项研究不仅丰富了人类对肠道真菌多样性的认识，还揭示了肠道真菌与多种疾病（如炎症性肠病）的相关性。研究团队构建了一个包含760个真菌基因组的培养肠道真菌目录（CGF），涵盖了48科206种真菌，其中包括69种新发现的物种。通过将CGF目录与公开可用的人类相关真菌（PHF）基因组资源相结合，研究团队分析了来自中国人群（涵盖28种疾病或不健康状态）的6000多个粪便宏基因组和来自非中国人群的5000多个粪便宏基因组中的肠道真菌组。这使得详细探索与各种疾病相关的肠道菌群的多样性和结构特征成为可能。

这项研究为理解肠道健康和疾病提供了新的视角，有望为未来的实验研究和临床应用提供重要参考。研究团队表示，这些资源和发现极大地丰富了人们对人类肠道菌群的生物多样性和疾病相关性的理解。

本文原文来自bioon.com