京都大学等整理10万份癌症病理检查数据,助力新药研发效率提升
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京都大学等整理10万份癌症病理检查数据,助力新药研发效率提升
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京都大学附属医院与NTT集团合作,成功构建了一个包含10万份癌症患者病理检查数据的数据库。该数据库通过自然语言处理和图像解析技术,实现了对患者个体化基因突变信息的精准提取,将为新药研发提供重要支持。
京都大学医学部附属医院与NTT集团的新医疗真实世界数据研究机构(PRiME-R,位于京都市)合作整理了10万份癌症患者的病理检查诊断报告的数据,并构建了数据库。该数据库将助力制药企业在开展新型抗癌候选药物临床试验时,快速锁定拥有目标患者较多的医院。从而有助于削减新药研发成本并缩短开发周期。
以京都大学附属医院为中心构建了包含10万份病理检查结果的数据库(供图:京都大学)
癌症病理检测报告由病理诊断专家通过分析癌细胞类型和基因突变等指标后进行诊断,书写给主治医师。由于诊断书是用自然语言书写的,因此计算机无法对其直接分析。而且不同医院和科室保存报告的场所也各不相同,收集大量数据本身就很困难。
京都大学附属医院与NTT集团的PRiME-R联合大阪红十字医院、福井大学医学部附属医院等6家癌症患者较多的大型诊疗机构,创建了一种自动收集并整理患者病历信息和病理诊断报告的系统。通过自然语言处理与图像解析技术,成功实现了患者个体化基因突变信息等内容的精准提取。
基因突变类型信息可用于筛选潜在有效的治疗药物等。通过该数据库,制药企业可快速锁定携带罕见基因突变患者的分布医院及数量,显著提高新药开发的临床试验患者的募集效率。
例如,占乳腺癌患者15%的、具有“三阴性”基因特征的患者治疗效果比其他类型更差,因此对于开发高效治疗药物有很大的需求。使用此次构建的数据库,就能知道哪些医院有多少三阴性患者。据项目负责人透露,目前已收到多家制药企业的合作咨询。
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