病毒的分类及结构特点
病毒的分类及结构特点
病毒是自然界中最小的微生物,它们没有细胞结构,只能寄生在宿主细胞内进行复制和繁殖。自1898年荷兰微生物学家贝杰林克提出“病毒”概念以来,数百万种病毒中的11000多种病毒已被详细记录,其中约270种病毒可感染人类致病。本文将为您详细介绍病毒的四种主要分类方法及其特点。
自1898年荷兰微生物学家贝杰林克(Beijerinck)提出“病毒”概念以来,数百万种病毒中的11000多种病毒已被详细记录,其中约270种病毒可感染人类致病[1]。
有别于原核生物与真核生物,病毒本身并不存在细胞核与细胞器等结构,因此必须入侵其他生物细胞,并借助宿主细胞完整复制增殖等过程。
图1. 常见病毒类型
病毒的分类方法主要有四种:(1)根据病毒形态分类;(2)根据宿主分类;(3)ICTV病毒分类法;(4)巴尔的摩病毒分类法。
根据病毒形态分类
1927年,植物病毒学家约翰逊注意到病毒分类的必要性,提出根据病毒形态划分,可分为球状、冠状、杆状、丝状、砖状、子弹状等。
图2. 形态各异的病毒
根据宿主进行分类
1939年,霍姆斯提出根据宿主反应和种类对植物病毒进行分类,但只能描述89种植物病毒。按照这种方式,病毒可分为动物病毒、植物病毒、其他微生物病毒(如细菌、真菌等)三种。
ICTV病毒分类法
1966年,在莫斯科举行的国际微生物学大会上,43名病毒学家挺身而出组成委员会,主要目标是创建全世界均可接受的病毒分类和命名系统。1974年该委员会更名为国际病毒分类委员会(The International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)[2]。
ICTV根据病毒之间的亲缘关系、进化关系和遗传物质,按照界门纲目科属种的生物分类方法,对病毒进行全面分类并每年更新。
2019年,ICTV对病毒分类方法做出重大更新。更新后,病毒共分为6域10界17门40纲72目264科2818属11273种。
图3. ICTV病毒分类法
其中,6域分别是(中文名称仅供参考):
(1)双链DNA病毒域(Duplodnaviria)遗传物质为双链DNA,且均含有独特的二十面体蛋白衣壳,衣壳中含有独特的折叠结构,称为HK97折叠。
(2)单链DNA病毒域(Monodnaviria)包括所有的单链DNA病毒,但同时也包括某些线性单链DNA和环状双链DNA病毒。
(3)A型DNA病毒域(Adnaviria)包括具有丝状病毒体(即病毒体)和线性双链 DNA 基因组的古细菌病毒。遗传物质为A型DNA(相比B型DNA具有更短、更紧凑的右手螺旋结构)。
(4)核酶病毒域(Deltavirus) 该病毒域为卫星核酸,是一种类似于病毒的感染因子,但如果没有辅助病毒便无法复制。该病毒域中存在基因组和反基因组核酶。
(5)核糖病毒域(Riboviria)该病毒域包括所有使用同源RNA依赖聚合酶进行复制的病毒,如RdRp酶(即RNA复制酶)和RdDp酶(即逆转录酶)。许多疾病都是有该域的病毒引起的,如冠状病毒、埃博拉病毒、艾滋病毒、流感病毒和狂犬病毒等。
(6)多样DNA病毒域(Varidnaviria)包括所有包含垂直果冻卷折叠的主要衣壳蛋白的DNA病毒。目前已知的大多数真核DNA病毒均属于该病毒域。
ICTV病毒分类法虽然科学严谨,但实用性相对欠佳。
巴尔的摩病毒分类法
1971年美国微生物学家大卫巴尔的摩提出根据病毒遗传物质和复制过程,将病毒分为7种类型的方法,被称为巴尔的摩病毒分类法,该方法极具实用性,也是目前最常见的一种病毒分类方法[3]。
图4. ICTV与巴尔的摩病毒分类法比较[3]
(1)双链DNA病毒(dsDNA )以双链DNA作为遗传物质,进入宿主细胞后,通过利用宿主细胞的RNA聚合酶转录出带有合成病毒蛋白质信息的mRNA,进而翻译出所需蛋白质,同时通过宿主细胞的DNA聚合酶合成子代DNA,通过将二者组装形成新的子代病毒。
代表病毒:腺病毒、疱疹病毒、痘病毒等。
图5. 双链DNA病毒复制过程
(2)单链DNA病毒(ssDNA)以单链DNA为遗传物质,进入宿主细胞后,先利用宿主细胞的DNA聚合酶以自身正链DNA为模板合成负链DNA,组装形成双链DNA,再利用宿主细胞RNA聚合酶从负链DNA中转录出带有合成病毒蛋白质信息的mRNA,进而翻译出所需蛋白质,同时通过宿主细胞的DNA聚合酶以负链DNA为模板合成子代正链DNA,通过将二者组装形成新的子代病毒。
代表病毒:细小病毒等
图6. 单链DNA病毒复制过程
(3)双链RNA病毒(dsRNA)以双链RNA为遗传物质,进入宿主细胞后,直接利用宿主的RNA聚合酶以自身正负链为模板合成相应互补链,其中负链RNA合成的正链RNA可以作为mRNA翻译出所需蛋白质,最后组装形成新的子代病毒。
代表病毒:轮状病毒、呼肠孤病毒等。
图7. 双链RNA病毒复制过程
(4)**正义单链RNA病毒(+ssRNA) **以正义RNA单链为遗传物质。该正义链进入宿主细胞后,可以直接作为mRNA链指导蛋白质的合成;也可以通过依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)作用,生成双链RNA。之后双链解旋,再以负链为模板,在RDRP作用下,生成双链后再解旋,生成新的正链。这样就达到了复制的目的。同时,生成的正链也可作为mRNA指导蛋白质的合成。
代表病毒:新冠病毒、诺如病毒、丙肝、甲肝病毒、登革热等。
图8. 正义单链RNA病毒复制过程
(5)反义单链RNA病毒(-ssRNA) 以负链RNA为遗传物质,进入宿主细胞后,在宿主细胞后,先利用RNA聚合酶以负链RNA为模板合成mRNA,即正链RNA,再以正链RNA为模板合成负链RNA,同时以正链RNA(mRNA)转录产生所需蛋白质,最后组装形成新的子代病毒。
代表病毒:流感病毒、狂犬病毒等。
图9. 反义单链RNA病毒复制过程
(6)单链RNA逆转录病毒(ssRNA-RT) 以单链RNA为遗传物质,无所谓正负,进入宿主细胞后,先利用逆转录酶将自身单链RNA逆转录为cDNA,再利用宿主细胞的DNA聚合酶合成双链DNA,整合进入宿主细胞基因组,最后再利用宿主细胞的RNA聚合酶将cDNA转录出mRNA,合成所需蛋白,组装形成新的子代病毒。
代表病毒:HIV病毒等。
图10. 单链RNA逆转录病毒复制过程
(7)双链DNA逆转录病毒(dsDNA-RT) 以双链DNA为遗传物质,进入宿主细胞后,先利用宿主细胞依赖DNA的RNA聚合酶转录出正链RNA,再逆转录形成负链DNA,而后利用DNA聚合酶补齐正链形成双链DNA,整合进入宿主细胞基因组,最后再转录出mRNA,合成所需蛋白质,组装形成新的子代细胞。
代表病毒:乙肝病毒等
图11. 双链DNA逆转录病毒复制过程
相比于其他5种病毒,逆转录病毒最为特殊,这种病毒会将自身遗传信息整合到宿主细胞DNA上,随着宿主细胞DNA的表达而增殖,原理上永远无法被完全治愈。这也是艾滋病及乙肝难以完全治愈的主要原因。
病毒分类以ICTV分类法最为严谨,以巴尔的摩分类法最为实用。巴尔的摩分类方法不仅揭示病毒的复制过程和类型,而且对病毒的治疗也具有指导意义。
参考资料:
(1)https:///10.1016/j.tim.2022.07.002