“多重比较”选项卡：双因素ANOVA
“多重比较”选项卡：双因素ANOVA
在进行双因素ANOVA分析时，如何选择合适的多重比较方案是一个关键问题。本文将详细介绍GraphPad Prism软件中各种多重比较选项的适用场景和具体操作步骤，帮助用户更好地理解和应用这些统计工具。
为双因素ANOVA选择多重比较并非易事。在了解双因素ANOVA之后，请谨慎做出选择。考虑寻求帮助。
哪种比较？
这是最重要的决定。您需要选择一个符合您的科学目标的多重比较方案。下图和对话框中显示的图片可能比说明更有用处
比较的选择（在下拉列表中）取决于数据集的行数和列数。
将每个单元格平均值与该行中的其他单元格平均值进行比较
这是Prism早期版本中的唯一选项，也可能是最有用的一种多重比较。此选项仅在恰好有两列的情况下才可用。因此，每行有两个单元格平均值时，Prism便会对它们进行比较。
将每个单元格平均值与该列中的其他平均值进行比较
此选项仅在恰好有两行的情况下才可用。
简单效应。在每行中对列进行比较
仅当有三列或更多列数据时，此选项才可用。在每行中，Prism在单元格平均值之间进行多重比较。对于每一行，比较一列与另一列并排重复项的平均值。只有这样比较才有意义，因此仅当有三列或更多列时，此选项才可用。必须决定每一行是否会成为其自己的比较族，或者是否将所有比较定义为一个族。
简单效应。在每列中对行进行比较
在每一列中，比较一行并排重复项的平均值与其他行的平均值。仅当有三行或更多行时，此选项才可用。必须决定每一列是否会成为其自己的比较族，或者是否将所有比较定义为一个族。
主要列效应
主要列效应的测试包括计算每个数据集列的平均值，并进行比较。只有三个或更多数据集列中存在数据时，才有意义（因此可使用该选项）。如果数据表只有两个数据集列，则主ANOVA计算将为定义列的变量的效应提供一个P值，对列效应进行多次比较测试毫无意义。
主要行效应
主要行效应的测试包括计算每行的平均值，然后进行比较。只有这样比较才有意义，因此当有三行或更多行时，此选项才可用。如果数据表只有两行，则主ANOVA计算将为定义行的变量的效应提供一个P值，对行效应进行多次比较测试毫无意义。
不考虑行和列比较单元格平均值
将每个单元格平均值与其他每个单元格平均值进行比较，而无需考虑每个单元格平均值属于哪一行和哪一列。当重复测量某项因素时，此选项不可用，但当重复测量两项因素时，此选项可用。
将单元格平均值与其所在行和列中的其他平均值进行比较
将每个单元格平均值与其所在行和列中的其他单元格平均值进行比较。其结合了其他两个选项中可用的比较（在每行内比较列，和在每列内比较行）。
多少次比较？
是否想把（数据集中）每个平均值与其他平均值进行比较？或者仅将每个平均值与对照平均值进行比较？后一种方法比较少，因此更有检验力。应基于实验设计以及您提出的科学问题做出选择。
第三个选项可用于一些多重比较法，以允许您比较预选单元格对的平均值。此选项可用于：
•比较行平均值（主行效应量）
•比较列平均值（主列效应量）
•不考虑行和列比较单元格平均值
当您选择此选项时，您还需要定义您希望进行的特定比较。首先通过单击“选择...”按钮
在所出现的对话框中，随后您将指定定义您感兴趣的比较的行/列。请注意，Prism将自动从这些下拉菜单中过滤掉已选择的或没有意义的选项（例如，您无法将一个单元格与其自身进行比较！）。
有多少个族？
此选项仅可用于上面定义的某些多重比较选项。这些选项包括：
•在每行中，比较列（行中的简单效应）
•在每列中，比较行（列中的简单效应）
•将单元格平均值与其所在行和列中的其他平均值进行比较
为什么此选项至关重要？多重比较会考虑比较族中的比较次数。显著性水平（α）适用于整个比较族。同样，置信水平（通常为95%）适用于整个区间族，多重调整后P值根据一个族中的比较次数来调整每个P值。
如果选择上面列出的多重比较选项中的一个，则族的定义并不明显。根据您所选择的选项，Prism提供有不同选项：
在每行中，比较列（行中的简单效应）
•每行一个族（推荐）。使用此选项，每行内的比较成为其自身的比较族。因此，族的数量与数据行的数量相同。在该选择下，每个族的比较较少（但族更多），因此比较更有检验力。除非您有充分的理由考虑将所有比较分组到单一族中，否则我们推荐您选择此选项。
•所有比较一个族（保守）。使用此选项，无论数据中的行数如何，始终存在一个比较族。该方法效力较小，原因在于其对多重比较应用了更严格的校正。但这种选择也有道理，因为族中的比较更多。
在每列中，比较行（列中的简单效应）
•每列一个族（推荐）。使用此选项，每列内的比较成为其自身的比较族。因此，族的数量与数据列的数量相同。在该选择下，每个族的比较较少（但族更多），因此比较更有检验力。除非您有充分的理由考虑将所有比较分组到单一族中，否则我们推荐您选择此选项。
•所有比较一个族（保守）。使用此选项，无论数据中的列数如何，始终存在一个比较族。该方法效力较小，原因在于其对多重比较应用了更严格的校正。由于一个族中有多个比较，因此这种选择也有道理。
将单元格平均值与其所在行和列中的其他平均值进行比较
•P族。每行一个（N） +每列一个（M）（推荐）。在Prism中，将给出“P”、“N”和“M”的值且N+M=P，使用此选项，每行内的比较成为其自身的族，每列中的比较成为其自身的族。结果是每个族内的比较较少（但更多的族），因此比较效力较大。除非您有充分的理由对更少的族进行分组比较，否则我们推荐您选择此选项。请注意，选择此选项将会生成相同的调整后P值，正如您选择了多重比较选项“在每行内，比较各列（行内简单效果）”与每行一个族，并分别选择多重比较选项，“在每列内，比较各行（列内简单效果）”与每列一个族。
•2个族。行内的所有比较（1） +列内的所有比较（1）（更保守）。使用此选项，将行内的所有比较分组到单一族中，而将列内的所有比较分组到不同族中。此选项比“1个族”选项（下文）更有效，但比每行和每列内具有族的推荐选项（下文）更无效。请注意，选择此选项将会生成相同的调整后P值，正如您选择了多重比较选项“在每行内，比较列（行内简单效果）”与“所有比较一个族”选项，并单独选择了多重比较选项“在每列内，比较行（列内简单效果）”与“所有比较一个族”选项。
•1个族。所有比较（最保守）。使用此选项，无论数据中的行数或列数如何，始终存在一个比较族。这种方法的效力比其他任何一种方法弱，原因在于其对多重比较应用了更严格的校正。由于一个族中有多个比较，因此这种选择也有道理。
附加信息
结果页面将重复您选择待使用的族数，因此清楚说明如何解释结果。
Prism 5.04和5.0d使用了“每行/列一个族”的族定义（且并不为您提供其他定义的选项）。如果您希望将结果与Prism 5进行比较，则在5.04（Windows）和5.0d（Mac）之前的Prism 5版本中，注意的此错误。