新研究揭示新冠病毒可能源自华南海鲜市场野生动物
新研究揭示新冠病毒可能源自华南海鲜市场野生动物
一项新的国际合作研究提供了一份野生动物物种清单,这些物种可能揭示新冠疫情的源头。这项研究基于中国疾病预防控制中心(CDC)发布的一项对相关样本进行的元转录组学数据分析。这些数据来自2020年1月1日开始在华南海鲜批发市场及其周边地区收集的800多个样本,以及早期新冠肺炎患者的病毒基因组报告。9月19日,相关论文发表在细胞出版社(Cell Press)旗下期刊Cell(《细胞》)上。
“这是关于新冠肺炎起源的最重要的数据集之一。”论文共同通讯作者、法国国家科学研究中心(CNRS)的Florence Débarre说,“我们非常感谢(CDC)对这些数据的分析和分享。”
共同通讯作者、美国斯克利普斯研究所的Kristian Andersen说:“这些证据都指向同一个场景:2019年11月中下旬,受感染的动物流入市场,引发了这场疫情。”共同通讯作者、亚利桑那大学的Michael Worobey说:“我们用新的、严格的方法分析了CDC团队收集的这些至关重要的数据。”
2020年1月1日,华南海鲜批发市场关闭几个小时后,CDC研究人员前往市场采集样本。他们在地面、墙壁等表面进行了取样。几天后,他们又重点研究了出售野生动物的摊位,比如用来运送动物的笼子和手推车,并从排水沟和下水道收集了样本。
CDC研究人员对样本进行了元转录组测序,这项技术旨在获得样本中所有生物——病毒、细菌、植物、动物和人类——的所有RNA序列(也可以提取DNA)。2023年,CDC团队在《自然》上发表了相关数据和结果。然而,这篇文章没有指出数据涉及的动物物种的确切信息,而这些物种可能代表中间宿主。CDC在开放数据库上分享了他们的测序数据。
此次,对这些数据的最新分析显示,新冠病毒出现在收集自出售某些野生动物的摊位的样本中,包括貉和椰子猫。在某些情况下,甚至在相同的拭子上发现了来自新冠病毒和这些动物的遗传物质。研究人员通过对样本中的线粒体基因组进行基因分型,确定了确切的动物物种。
“在CDC团队到达之前,许多关键的动物已经被清除了,所以我们无法直接证明这些动物被感染了。”Débarre说,“但我们在环境样本中看到了这些动物的DNA和RNA碎片,而且其中一些相关摊位的样本中也发现了新冠病毒的踪迹。”
Worobey补充说:“我们知道,这些动物与2002年将SARS病毒传染给人类的动物是同类的。让携带大量病毒的野生动物与生活在大城市的人类接触是非常危险的,这些城市的人口密度使这些病毒很容易蔓延。”
该国际团队还对最早的新冠病毒的基因组进行了进化分析,并推断出感染人类并导致新冠肺炎大流行的病毒最可能的祖基因型。结果表明,在此次疫情暴发之前,即使有人类感染,数量也很少。实际上,在上游动物贸易中可能产生了影响有限的溢出效应。Débarre说:“新冠病毒的主要多样性从一开始就存在于市场上。”
这项新研究在该市场上发现了一小部分动物物种,这些动物与新冠病毒共同出现在样本中或存在位置十分接近,因此它们代表了最有可能的中间宿主。貉是一种对新冠病毒易感的物种,其在2003年也携带了SARS病毒。在一个带有新冠病毒RNA的摊位样本中,研究人员也发现了来自椰子猫的遗传物质,其也与早期SARS的暴发有关。花白竹鼠和马来亚豪猪等许多物种,也被发现存在于新冠病毒阳性样本中。
虽然数据无法证明这些动物中是否有一只或多只被感染,但相关分析提供了一份最可能携带新冠病毒的物种的清单,以及有助于追踪它们起源的遗传信息。
研究人员强调了了解新冠肺炎起源的重要性,特别是考虑到最近其他的溢出效应,例如美国牛群中禽流感病毒的传播。“关于新冠病毒的起源有很多虚假信息和错误信息。弄清这一点之所以如此重要,是因为这影响到全世界的国家安全和公共卫生。事实是,尽管人们越来越关注实验室安全,但仍没有采取太多措施来减少这种人畜共患病再次发生的可能性。”Worobey说。
本文原文来自腾讯新闻