张和平团队发布全球最大乳酸菌基因组数据库
张和平团队发布全球最大乳酸菌基因组数据库
近日,由全国政协委员、内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室主任张和平教授带领的团队发布了全球最大的乳酸菌基因组数据库iLABdb。该数据库破解了6.2万余个乳酸菌基因组,为全球乳酸菌研究与产业发展贡献积极力量。这一重大成果再次展现了我国在微生物学研究领域的领先地位和国际影响力,标志着中国益生菌产业迈入新的发展阶段。
全球最大乳酸菌基因组数据库诞生
该数据库收录了超过62000个乳酸菌基因组及其相关元数据,其中包括11000多个新测序的乳酸菌基因组,覆盖了广泛的地理和宿主背景。数据库不仅提供了从菌株到全基因组的综合信息,还收录了1054项临床益生菌干预研究文献,以促进科学循证和医学研究。
数据库具备基于全基因组序列的搜索功能,可帮助科研人员快速浏览、查询、分析及可视化乳酸菌基因组特征。同时,该平台还为提交新的乳酸菌基因组或展示具有临床效益的明星菌株信息提供了开放接口。
三十余载科研积淀
张和平教授团队在乳酸菌研究领域深耕30余年,建立了全球最大的乳酸菌种质资源库,分离保藏乳酸菌4.7万余株。团队从全球六大洲46个国家采集自然发酵乳制品等样品6663份,积累了丰富的菌种资源。
团队成员包括多位博士后和博士研究生,研究方向涵盖乳酸菌筛选、乳品发酵技术等多个领域。张和平教授本人是国家杰出青年科学基金获得者、长江学者特聘教授,曾获何梁何利科技创新奖等多项荣誉。
开创乳酸菌研究新纪元
乳酸菌作为微生物领域的重要战略资源,已在食品、工业、医疗、健康、农业和生态保护等多个领域得到广泛应用。然而,由于乳酸菌系统发育关系的复杂性以及菌株间功能和代谢的巨大差异性,传统实验方法难以满足对其深入研究和高效挖掘的需求。
iLABdb数据库的建立,为研究人员提供了强大的数据支持和分析工具。通过该平台,科研人员可以更准确地识别菌株遗传背景,直观地探索乳酸菌基因组中关键功能区域,高效地分析乳酸菌功能特性和潜在应用价值。
未来展望
张和平教授表示,团队计划进一步扩大数据库的覆盖范围,到2023年年底完成2万株,2024年达成3万株乳酸菌分离株的基因组测序工作。未来,iLABdb 2.0版将实现对乳酸菌遗传特性、遗传潜力和进化溯源的深入分析,3.0版将基于人工智能实现更广泛、更深入、更聚焦的乳酸菌功能预测。
这一重大科研成果的发布,不仅为全球乳酸菌研究与产业进步开启了新篇章,也标志着我国在这一领域的研究迈向了新的里程碑。随着数据库的不断完善和升级,相信将在推动相关产业技术创新和可持续发展方面发挥越来越重要的作用。