单细胞ATAC测序：解锁癌症治疗新思路

单细胞ATAC测序：解锁癌症治疗新思路

单细胞ATAC测序（Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing）是一种革命性的基因组学技术，通过检测染色质开放状态来揭示细胞内的基因调控机制。这项技术正在为癌症研究和治疗带来新的突破。

揭示肿瘤免疫治疗的新机制

北京大学张泽民教授团队在三阴性乳腺癌（TNBC）研究中，创新性地将单细胞ATAC测序与RNA测序、TCR测序等多组学技术相结合，深入分析了肿瘤微环境中的免疫细胞亚群特征。

研究发现，紫杉醇化疗虽然能减少抗肿瘤免疫细胞，但会增加免疫抑制性巨噬细胞。通过单细胞ATAC-seq数据，研究人员观察到表达CXCL9的促炎性巨噬细胞与CXCL13+ T细胞密切相关，这些细胞能够耐受紫杉醇的不良影响，从而成为免疫应答的关键因素。

发现CD8+T细胞耗竭的新靶点

在另一项研究中，张泽民教授团队通过分析21种肿瘤病人的单细胞转录组和ATAC-seq数据，鉴定出ETV7转录因子是驱动CD8+T细胞耗竭的关键因子。ETV7通过调控多个耗竭相关基因，将CD8+T细胞的命运从记忆状态转向终末耗竭，从而抑制其抗肿瘤功能。

进一步的临床前实验表明，靶向ETV7可以显著增强CAR-T细胞的抗肿瘤效果，为开发新的免疫治疗方法提供了重要线索。

技术优势与未来展望

单细胞ATAC测序技术具有以下显著优势：

• 高分辨率：能够精确检测每个细胞的染色质开放状态
• 多组学整合：可与RNA测序等技术联合使用，提供全面的基因表达和调控信息
• 低样本需求：仅需少量细胞即可获得有效数据

这些特点使其在癌症研究中展现出巨大潜力。通过揭示肿瘤微环境中的细胞异质性和调控机制，单细胞ATAC测序不仅有助于发现新的治疗靶点，还能监测治疗反应和耐药机制，为实现精准医疗提供了新的工具。

随着技术的不断发展和完善，单细胞ATAC测序有望在未来的癌症研究和临床实践中发挥越来越重要的作用，为患者带来更有效的治疗方案。