GraphPad Prism绘制热图

GraphPad Prism绘制热图

热图（Heatmaps）是将数据矩阵中的各个值按一定规律映射为颜色来进行展示，利用颜色变化实现数据的可视化。通过热图，我们可以快速地了解数据的分布规律、热点区域以及密度变化情况，为图像分析提供直观的参考依据。本文将详细介绍如何使用GraphPad Prism软件绘制热图。

一、案例数据

热图（Heatmaps）是将数据矩阵中的各个值按一定规律映射为颜色来进行展示，利用颜色变化实现数据的可视化。通过热图，我们可以快速地了解数据的分布规律、热点区域以及密度变化情况，为图像分析提供直观的参考依据。根据下列范例数据（范例数据为随机数据，无生物学意义），利用GraphPad Prism软件绘制热图。

二、软件操作方法

1. 图表选项
   1.1 打开Graphpad Prism软件，图表类型选择“Grouped”；
   1.2 勾选“Enterorimport data into a new table”；
   1.3 Options选择“Enter and plot a single Y value for each point”；
   1.4 点击“Creat”创建新图表。（图1）

图1 创建图表

2. 写入/导入数据（图2）。

图2 数据录入

3. 在左侧项目列表中Graphs处选择Date 1，图表类型选择“Heat Map”，并在其中选择一种配色方案，即可初步得到绘制的热图。（图3）

图3 生成曲线图形

4. 图形调整与优化：
   4.1 颜色设置：双击绘图区域，打开Format Graph窗口，在Color mapping选项卡下，修改Colormap为“Doublegradient”，在Range选项下可修改颜色范围，也可自定义最小值和最大值。（图4-1）

图4-1 热图颜色修改

4.2 坐标设置：在Format Graph窗口中点击“Labels”，“Row Labels”中修改横坐标标签信息，Mark选项选择“Every”，可以在“Font”中修改字体；“Column Labels”修改如同“Row Labels”。修改后点击“Apply”。（图4-2）

图4-2 横纵坐标标签信息修改

4.3 热图边框修改：切换至Graph Settings选项卡，修改Heatmap borders的粗细为“1 pt”，即热图边框的粗细，也可修改颜色。勾选“Cell borders”可显示每个单元格的边框，如图4-3。

图4-3 热图边框修改

4.4 显示坐标标题：切换至“Titles”选项卡，勾选“Show row labels title”和“Show column labels title”即可。（图4-4）

图4-4 热图坐标标题修改

5. 若需要对热图添加间隙，可打开Format Graph窗口，点击Gaps选项，对“Vertical gaps”和“Horizontal gaps”进行编辑，比如我们需要横向和纵向都进行分组，可以如图5进行设置。

图5 热图添加间隙设置