用科研利器 Zotero做好文献管理
用科研利器 Zotero做好文献管理
本文选自《读好文献：写作导向的学术阅读指导》，作者傅力。
文献管理软件是一种用于收集、整理、检索和管理学术文献的工具。它可以帮助你快速收集和整理各种学术文献，通过自动化的检索和导入功能，你可以轻松获取大量的文献信息，并将其整理成清晰的文献库。文献管理软件提供了强大的检索功能，你可以通过关键词、作者、标题等信息快速定位到所需文献。同时，软件还可以根据你设定的筛选条件，自动过滤和排序文献，帮助你快速找到最相关的研究成果。
文献管理软件通常提供了方便的阅读和标注功能。你可以在软件中直接打开文献文件，进行高亮、批注、书签等操作，方便后续的阅读和参考。此外，一些软件还支持导出文献摘要和引用信息，方便用户写作和引用参考文献。
文献管理软件与写作软件（如Word、LaTeX）的集成，能让你可以方便地插入引用和生成参考文献列表。你可以通过软件提供的插件或扩展，将文献库中的文献信息直接导入到写作软件中，避免繁琐的手动引用和格式调整过程。
文献管理软件自然有学习的门槛，但不高，学会后你可以节省了大量的时间和精力，更加高效地完成文献收集、文献回顾和写作工作。一般来说，Noteexpress、Endnote、Citavi、Mendeley和Zotero这五款是用户数量较多的文献管理软件。如果你阅读的都是中文文献，那么Noteexpress可以是你的选择，它是一款国产软件，因此对于中文文献适配很好。如果你需要阅读英文文献，Mendeley和Zotero是两款非常好的软件，而且它们免费。
这些文献管理软件虽然在细节上有所差异，但几乎所有每一款都已经具备了基本的功能。这里我就以个人使用最顺手的Zotero作为例子，通过官网的指南来展示文献管理工具在文献阅读中的应用。
Zotero的基本操作
Zotero的安装可以在以下网址找到，支持Mac，Windows和Linux操作系统：
https：//www.zotero.org/download/。
Zotero的操作页面如图6-1所示。
如何打开Zotero？
Zotero可以像其他程序一样从操作系统界面的图标或文件管理器中打开，如图6-2所示。
Zotero可以整理哪些文献资料？
Zotero可以用于整理不同类型的文献资料，选择类型中包含报纸、文章、博客帖子、期刊文章、图书、图书章节、百科条目、报告、标准、播客、采访稿、词条、地图、电视广播、电台广播、电影、电子邮件、法案、法律、会议论文、即时消息、论坛帖子、软件、视频、手稿、数据集、司法案例、听证会、文档、信件、学位论文、演示文档、艺术品、音频、预印本、杂志文章、专利，如图6-3所示。
单一文献资料包含哪些信息？
选中单一文献后Zotero在右侧会出现该文献的详细信息，这包括标题、创建者、出版商、日期、页码以及引用条目所需的任何其他数据。
如何新建分类？
左侧窗格包括“我的文库”，其中包含库中的所有文献条目。右键单击“我的文库”或单击左侧窗格上方的“新建分类”按钮来创建一个新集合，一个集合中可以放置与特定项目或主题相关的项目。文献条目归入某个集合时，并不是以复制的形式进入每个集合。也就是说，Zotero的集合不像Windows的文件，而更像歌单的形式，一首歌可以加入不同的歌单中。但是对于不同文库，文献条目则是通过复制的形式从一个文库到另一个文库中。也就是说文库更像曲库，不同曲库的歌曲需要复制。
如何给文献打标签？
在文献右侧的标签栏可以为文献打上标签，标签由用户命名。标签筛选器位于Zotero的左下角，其显示了当前分类中所有条目所包含的标签。
如何在Zotero中搜索？
快速搜索可以显示文献条目、标签或全文内容与搜索条件匹配的项目。点击搜索框左边的放大镜图标可打开高级搜索窗口，允许进行更复杂或更限制性的搜索。高级搜索可以保存在左边的窗格中，它们类似于集合，但会自动更新新的匹配项。
添加文献笔记
可以通过右侧窗格中的笔记选项卡将富文本注释附加到任何文献条目上。
文献条目的附件
文献条目可以附加注释、文件和链接。这些附件显示在文献的下拉菜单中。通过单击文献条目旁的箭头，可以显示或隐藏附件。
手动添加文献条目
文献条目可以通过单击Zotero工具栏中的绿色“新建条目”按钮并选择适当的项目类型来手动添加。然后可以在右侧窗格中手动添加细节数据。这种方式并会在Zotero中常用，但对于无法在线获得的文献，它是一种替代方法。
用Zotero收集文献
在了解了以上最基本的Zotero操作信息后，你需要知道如何将网络上看到的文献变成软件中的文献条目。你需要根据自己的网页浏览器，安装适用的Zotero Connector， Chrome， Firefox、Safari和Edge都有属于自己的Zotero Connector。Zotero Connector的“保存”按钮是最方便、最可靠的方式，将网页上的书目元数据添加到Zotero。只需浏览网页时，Zotero Connector就会自动搜索网页上的书目信息，并通过简单的点击操作，让您将其添加到Zotero中。
网页抓取
在某些网页上，例如包含一本专著不同章节的信息，“保存”按钮将以文件夹图标的形式呈现。当你点击时，Zotero Connector将打开一个窗口，您可以在其中选择要保存到Zotero的信息。这个窗口允许您选择特定的书目条目，以便将其保存到您的Zotero库中。
在你点击＂保存＂按钮后，Zotero Connector会弹出一个窗口，让你选择将该条目保存到哪个Zotero集合中。如果你希望将该条目保存到其他分类或库中，您可以在这个窗口中进行更改选择。同时，你还可以在保存时通过输入为新条目分配标签，以便更好地组织和标记你的文献库。
通过标识符添加
另外一种添加文献条目的方法是通过标识符添加，但前提是你已经知道出版物的ISBN，文献的DOI或PMID，arXiv ID 或ADS 条码。Zotero会通过在线的数据库进行直接调去，生成与之匹配的文献条目。不过这种情况的使用概率并不多。
如果你已经习惯了下载文献的PDF，可以让Zotero直接来抓取PDF文件中的元数据，自动创建条目。你需要添加PDF附件，可以直接通过拖拽文件到Zotero或点击添加按钮来添加附件。一旦你添加了附件，Zotero将自动为PDF附件创建一个条目，并尝试抓取PDF中的信息。它还会根据抓取到的信息为附件进行重命名。
Zotero的PDF元数据抓取功能是通过Zotero的Web服务来查找元数据的。在抓取过程中，Zotero客户端会将PDF文件的前几页发送到Zotero服务器。然后，服务器会利用Web服务和各种抓取算法来提取PDF上的元数据。这些元数据会与Crossref的数据、DOI和ISBN匹配的数据进行比对，以构建PDF的条目。
对于大多数PDF文件，Zotero能够成功抓取到元数据。然而，由于PDF文件的特性，不能完全依赖抓取功能来获取所有的书目信息。需要注意的是，尽管自动抓取功能能够方便地导入大量PDF文件，但这并不意味着它是创建条目的最佳方法。使用Zotero Connector插件可以更快地从网站或学术数据库导入项目，它能够节省下载PDF并手动添加到Zotero的步骤，同时也提供更高质量的保存元数据。
从其他文献管理软件导入
如果你想要从其他文献管理软件（如Endnote、Citavi、Mendeley等）迁移到Zotero，需要先从你当前使用的文献管理软件中导出书目数据。具体的导出步骤可能因软件而异，但通常可以在软件的导出选项或菜单中找到相应功能。然后在Zotero中打开“文件”菜单，然后选择“导入”选项。在弹出的窗口中，浏览并选择您之前导出的书目文件，然后点击“打开”按钮。Zotero将会创建一个以日期命名的集合，并将导入的书目数据放入其中。你可以在Zotero的左侧面板中找到这个新创建的集合。
Zotero中文献信息的简单修改
Zotero可以准确地从网站上导入元数据，但由于网站上的元数据可能本身就是不准确，因此需要进一步的检查条目的文献信息。下面简单说明最重要的作者和期刊信息。
每个文献条目可以有零个或多个不同类型的创建者，例如作者、编辑等。要更改创建者类型，请单击创建者字段标签。要删除创建者，单击创建者字段末尾的减号按钮。这将删除该创建者字段及其相关信息。要添加创建者，单击最后一个创建者字段末尾的加号按钮。这将在最后一个创建者字段之后添加一个新的创建者字段，供你填写相应的信息。若要对多个创建者字段进行排序，请单击创建者字段标签，并选择“上移”或“下移”选项。这将能够重新排列多个创建者字段的顺序。
在期刊文献的引用中，期刊名称通常以缩写形式呈现。为了处理这一情况，Zotero将期刊名称的全程和期刊名称的缩写存储在两个不同的字段中，分别是“期刊”字段和“刊名缩写”字段。
Zotero同一库中的同条目之间可以相互关联，但不支持跨库的条目关联。要创建条目之间的关联，只需选中一个条目，然后打开右侧边栏的“关联文献”页面。点击“添加”按钮，在弹出窗口中选择一个或多个条目。完成上述步骤后，选定的条目将在该条目的“关联文献”页面中显示。如果你单击这些条目，Zotero将会跳转到这些条目所在的位置。通过使用关联功能，你可以更好地组织和链接不同条目之间的关系，以便更方便地进行参考和阅读。请注意，条目之间的关联是双向的，但不会传递。当你将条目A与B关联时，Zotero会自动使B与A关联。然而，如果存在A关联B、B关联C的情况，A并不会自动与C关联。
关联功能的作用一般包括以下几点：
（1）将书籍的章节与对应的书籍本体（或卷）关联起来。
（2）将书评与相应的书籍关联起来。
（3）关联不同版本的文献，例如将会议论文与发表的期刊文章关联起来。如果文献最终出版成书籍，还应将其与书籍进行关联。
（4）关联不同分类中相关的条目，以便更好地组织和浏览相关内容。
（5）将独立的笔记与所讨论的文献进行关联，以便在需要时查看相关信息。
（6）将在摘要或笔记中提及的文献与当前条目进行关联，以便更好地跟踪引用和相关信息。
（7）将具有相似内容的条目进行关联，以便更方便地查找相关文献和资料。
Zotero的扩展插件
Zotero的能力不仅仅在于软件本身，更在于它可以集成丰富的插件。以下是利用Zotero管理文献时非常有用的一系列插件。
- ZotFile：用于管理附件，自动将PDF（或其他文件）重命名，移动和附加到Zotero项目，将PDF从Zotero库同步到其他的操作端（例如平板电脑等）。
- Quicklook：在不安装任何插件的情况下，Zotero如果想阅读某个文献，需要双击该文献条目，然后会在默认的PDF阅读软件中打开。由于PDF文阅读软件往往不能秒速打开文件，这种方式势必会影响文献的查找的效率，特别是文献很多的情况下。在安装了Quicklook插件之后，按下空格键便可以预览文献。
- Jasminum：根据中文pdf，自动抓取条目信息。
- Zutilo：Zotero的快捷键设置。
- Zotero Update Ifs：用于显示论文发表期刊的影响因子。
- Zotero OCR：在Zotero中的PDF李执行OCR的功能。
- Zotero Tag：可以自动添加或者移除标签
- Zotero PDF Translate：便于阅读英文文献，可以选取英文全篇或一个段落或者单个单词进行翻译。
- Zotero Scihub：利用Sci-hub实现在Zotero下载文献。
- Zotero GPT：辅助文献阅读。
其他Zotero插件的信息可以在该网址获得：https：//zotero-chinese.gitee.io/zotero-plugins/#/