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ARMS PCR——基因突变检测新技术!

创作时间:
作者:
@小白创作中心

ARMS PCR——基因突变检测新技术!

引用
1
来源
1.
https://www.yeasen.com/news/detail/869

随着医学研究的不断发展,靶向治疗的越来越成熟,而靶向治疗的前提是对药物的分子靶点进行基因检测,找到导致遗传病或肿瘤发生的基因突变。ARMS-PCR是一项在PCR基础上发展起来的新方法,可检测出DNA中各种点突变,是目前国际上肿瘤个体化分子检测最重要、最广泛应用的技术之一,其在临床应用中的优势已被业内专家广泛认可。

ARMS-PCR即扩增阻滞突变系统PCR(Amplification Refractory Mutation System PCR,ARMS-PCR),又称为等位基因特异性PCR(Allele-Specific PCR,AS-PCR),通过引物3’末端引物设计控制等位基因特异性延伸,并结合Taqman探针的方法检测荧光信号值,从而判断野生型等位基因和突变型野生基因。

ARMS PCR引物设计时等位基因两条上游引物中3’端核苷酸不同,两条引物分别对野生型和突变型特异。扩增时,与模板不能完全匹配的上游引物将不能完全形成互补碱基对,形成错配,延伸受阻,不能产生PCR产物,而与模板匹配的引物体系则可以扩增出相应的PCR产物,Taqman探针上相应的荧光基团可产生荧光信号被仪器检测到,通过分析荧光数据确认其基因型。


图1:ARMS-PCR基本原理(图源于网络,侵删)

翌圣公司基于扩增阻滞原理开发了一款试剂盒,能够有效进行ARMS-PCR介导的基因分型。该产品具有以下特点:

  • 选择性高:可检测多种基因突变
  • 灵敏度高:突变型引物可检测低至10ng/ μL DNA中0.05%的突变
  • 判读简便:结果直观,客观判读结果,简便易行
  • 操作便捷:适用于多种PCR仪器,操作方法标准化,90分钟内完成上机检测

该产品的性能数据如下:

产品阻滞效果好

实验:模板投入量5μL,突变型引物扩增10ng/μL野生型模板和等拷贝数突变型质粒
位点:KRASG13D(38G>A)


图2:野生型引物扩增野生型模板和突变型模板。根据扩增曲线发现野生型模板无起峰或野生型和突变型Ct值差异≧6-8,可成功区分野生型和突变型基因

产品检测率可达0.05%

实验一:自混标准品制备方法(50%):50μL 10ng/μL野生型DNA+50μL 3×103copies突变型质粒。
位点:KRASG13D(38G>A)


图3:根据扩增曲线发现,产品在0.05%的浓度时仍有较好的表现

实验二:购买的5%的标准品(50ng/μL)用文库稀释液稀释成10ng/μL,进一步用10ng/μL 293gDNA稀释成0.1%和0.05%。
位点:L858R


图4:根据扩增曲线,位点在10ng/μL的野生型gDNA背景下检出率可高达0.05%,并经过商业化标准品进一步验证,说明我司产品检出率良好

产品稳定性好

产品反复冻融10次不影响其扩增以及阻滞效果

实验:红色:-20℃;绿色:真实反复冻融5次;蓝色:真实反复冻融8次;紫色:真实反复冻融10次。
位点:L858R


图5:13755试剂真实反复冻融10次不影响其扩增以及阻滞效果

在37℃,7天条件下不影响其扩增以及阻滞效果

实验:红色:-20℃;绿色&紫色:37℃7天。
位点:L858R

图6:13755试剂37℃,7天不影响其扩增以及阻滞效果

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