测序结果峰图如何分析：基因测序结果解读指南

测序结果峰图如何分析：基因测序结果解读指南

在生物学研究的前沿，DNA测序如同一扇揭示生命密码的神秘窗口，而解读测序的峰图就像是侦探破解复杂线索的过程。遇到1,2,5,6,8这样的峰图模式，我们不禁要质疑测序质量，但偶发问题有时只是技术的小插曲。面对3次出现的异常，或许我们可以宽容看待，毕竟一次性问题难以避免。然而，当信号如4、7这般衰减，测序能力的短板便显露无遗。9号峰图的微卫星迹象，则像是隐藏的宝藏，等待着深入探索。本文将带你走进DNA峰图的世界，解析那些移码、结构变化的奥秘，以及如何从测序结果中挖掘出疾病的蛛丝马迹。准备好了吗？让我们一起揭开基因测序分析的神秘面纱，踏上这场知识的探索之旅！

生物---测序的峰图如何解读一些疑难问题的解决

1,2,5,6,8这个算偶发问题吧，在序列两端出现的概率比较高。所以一般推荐双向测序，不过一个序列里出现这么多次的话，这个公司的测序能力不太好。

3还是可以接受的，一次测序的能力问题，再往后就是出现图4、7的情况，即信号减弱造成。附带一句，到600多就出现信号减弱，这个测序能力按现在说是弱了些。

9很好啊，这可能有个微卫星哦。如果是的话，这个序列后，如果是杂合子个体之后就会出现重叠峰

DNA峰图怎么判断结构、移码、结合之类的

DNA峰图就是DNA的一级序列，你只能看到序列信息，不能看到二级或三级结构。所以，移码是可以看出来的。比如

图中每一个主峰前面都有一个与之一样的小峰，说明测序样品是一个混合物，有少部分样品在这段序列之前的某一个位置有一处碱基缺失，造成了移码。

如果序列中有复杂DNA结构（例如发卡结构）有时会影响到测序反应，在峰图上的表示就是到某处之后峰图信号变差，可信度降低。例如，

正常测序反应800bp以内的信号都很好，但上图中前面信号很好，到310bp之后就突然变坏，就是DNA中有高级结构。

至于结合，不明白你的意思。但是测序中有一种多位点结合的问题，就是测序引物和模板匹配的特异性不高，致使引物可以在多个位点结合。因为测序本来就是一个PCR反应，如果引物多位点结合，产物就不是单一产物，表现在峰图上就是套峰。例如，

上图中每个位置除了一个主峰之外还有一个不可忽视的小峰，说明引物结合在两个不同的位置，测序的结果有两个，即主峰和套峰。产生这个问题的原因可能是测序引物设计的问题，也可能是模板不纯。

如何对基因测序结果进行分析

可以用另一端的引物进行测序，从另一端测序可以一直测到序列的末端，就可以在序列的末端得到您的引物的反向互补序列。

如果想用你现有的数据找疾病相关的基因／通路／网络，出门直走差异表达分析。

首先，看测序峰图，如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的，碱基所对应的编码是一致的，那么可以判断序列是可以使用的。如果出现双峰，信号中断等异常现象，那么需要重新制备或者克隆后再测序。

一般情况系是通过荧光定量PCR，可以测定目的基因相对于标准基因的倍数，选取一定的基准，就能知道目的基因的数量。但是有时候由于DNA样本含量很少，会选用二代高通量测序的方法来检测染色体的倍数。

测序得到基因序列后一般都需要进行序列比对，看和目的序列的差异情况，常用的软件有DNAman，还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对，推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。

克隆至质粒载体中后集中测序〔9，10〕。sAGE的最终结果是通过计算机统计得到的，根据某个标签出现频率的高低来判断并计算其所属基因表达的丰度。