胶质瘤基因分子检测报告看不懂？请看……
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脑胶质瘤是一种常见的原发性颅内肿瘤，其发病率在全身肿瘤中仅次于胰腺癌和肺癌。随着病理学的发展和分子检测技术的进步，越来越多的分子标志物被发现，这些标志物在胶质瘤的分类、分型、分级、预后和治疗方面发挥着重要作用。本文将为您详细介绍胶质瘤分子检测的相关知识。
2021版WHO中枢神经系统肿瘤分类标准
2021年发布的第5版《WHO中枢神经系统肿瘤分类》整合了肿瘤的组织学特征和分子表型，提出了新的肿瘤分类标准，重点推进了分子诊断在中枢神经系统肿瘤分类中的应用。这一分类是目前脑胶质瘤诊断及分级的重要依据。
什么是胶质瘤分子检测？
分子检测又叫生物标志物检测，是指在体内发现的某种分子，从而作为某种病症或异常的表现。在胶质瘤治疗中，生物标志物检测用于寻找基因、蛋白和其他标志物的分子变化。其中DNA的突变占据了这种变化相当重要的一部分。
胶质瘤常用分子病理学检测指标
分子标志物 | 遗传学变异 | 检测方法 | 诊断价值 | 预后意义 |
|---|---|---|---|---|
IDH1 | 突变(R132H/C/L/S/G) | 免疫组化，Sanger测序，焦磷酸测序，二代测序 | 胶质瘤分类的关键分子变异；可鉴别WHO1级胶质瘤与胶质增生 | 提示预后相对良好；在临床试验中常作为重要分组指标；与MGMT启动子甲基化密切相关；对放疗和烷化剂相对敏感；潜在的治疗靶点(例如lvosidenib） |
IDH2 | 突变(R172K/M/G/W） | Sanger测序，焦磷酸测序，二代测序 | - | 提示预后相对良好；对于放疗和烷化剂相对敏感 |
染色体1p/19q | 联合缺失 | FISH，PCR，甲基化芯片/表达谱芯片/二代测序相关方法 | 少突胶质细胞瘤的关键变异 | 提示预后相对良好；对于放疗和烷化剂相对敏感 |
H3 K27 | 突变（K27M) | 免疫组化，Sanger测序，二代测序 | 诊断弥漫性中线胶质瘤，H3K27突变型的关键参考指标 | 预后相对较差；可作为潜在治疗靶点(例如EZH2控制剂) |
H3 G34 | 突变(G34R/V) | 免疫组化，Sanger测序，二代测序 | 弥漫性中线胶质瘤，H3K27突变型 | 生存期比IDH突变型胶质母细胞瘤略长，但比IDH突变型WHO 4级胶质瘤短 |
ATRX | 突变 | 免疫组化Sanger测序，二代测序 | ATRX核表达缺失和/或p53突变阳性，可在不检测1p19q的情况下诊断为IDH突变型是形细胞瘤 | 相对于IDH突变型胶质母细胞瘤预后较好 |
TP53 | 突变 | 免疫组化Sanger测序，二代测序 | ATRX核表达缺失和/或P53突变阳性，可在不检测1p19q的情况下诊断为IDH突变型星形细胞瘤，可用于鉴别弥漫或非弥漫性WHO 1级胶质瘤及胶质增生 | - |
CDKN2A/B | 纯合性缺失 | FISH，qPCR，MLPA，甲基化芯片/表达谱芯片/二代测序相关方法 | 组织学缺少坏死和微血管增生的星形细胞瘤，IDH突变，WHO 4级胶质瘤的诊断指标之一 | 在IDH突变型胶质瘤中预后较差 |
TERT | 启动子突变(C228T/C250T) | Sanger测序，焦磷酸测序，二代测序 | 在少突胶质细胞瘤和胶质母细胞瘤中常见；在缺少组织学坏死和微血管增生的情况下，是胶质母细胞瘤，IDH野生型，WHO4级的诊断指标之一 | 在IDH野生型胶质瘤中预后较差；在IDH突变型胶质瘤中预后较好 |
染色体7/10 | +7/-10 | FISH，二代测序，微阵列芯片 | 在缺少组织学坏死和微血管增生的情况下，是胶质母细胞瘤，IDH野生型，WH04级的诊断指标之一 | 在IDH野生型胶质瘤中预后较差 |
EGFR | 扩增 | FISH，数字PCR，二代测序，微阵列芯片 | 星形细胞瘤，IDH突变型，WHO4级胶质瘤的诊断指标之一；胶质母细胞瘤，IDH野生型，WHO4级胶质瘤的诊断指标之一 | - |
EGFRvIII | 重排 | RT-PCR，数字PCR，免疫组化MLPA，二代测序 | EGFRvIII发生在约半数EGFR扩增的胶质母细胞瘤中 | 靶向治疗的潜在靶点 |
BRAF | 突变(BRAFV600E) | 免疫组化Sanger测序，焦磷酸测序，二代测序 | 在多种胶质瘤中出现，包括表皮型胶质母细胞瘤 | 靴向治疗的靶点(例如vemurafenib) |
MGMT | 启动子区甲基化 | 甲基化特异性PCR，焦磷酸测序，甲基化微阵列 | - | 在胶质母细胞瘤中预后较好；替莫唑胺治疗效果较好；与IDH突变和G-CIMP亚型相关 |
FGFR | 融合基因(FGFR-TACC) | Sanger测序，二代测序，qPCR | 在星形细胞瘤，IDH野生型，WHO4级和胶质母细胞瘤，IDH野生型，WH04级中出现 | 可作为靶向治疗的潜在点(例如FGFR控制剂） |
MET | 融合基因(PTPRZ1-MET)、突变(METex14) | Sanger测序，qPCR，二代测序 | 在星形细胞瘤，IDH野生型，WHO4级和胶质母细胞瘤，IDH野生型，WH04级中出现 | 在继发性胶质母细胞瘤(星形细胞瘤，IDH突变型，WHO 4级)中预后较差；可作为治疗靶点(例如MET控制剂) |
miR-181d | 高表达 | microRNA表达谱芯片，qPCR，原位杂交染色 | - | 在胶质母细胞瘤中表达较高时，对替莫唑胺化疗效果较好 |
TSC1/2 | 突变 | Sanger测序，NGS | 诊断室管膜下巨细胞星形细胞瘤的特异性标志物 | mTOR信号通路控制剂(如依维莫司)治疗靶点 |
ZFTA | 基因融合(C11orf95-RELA) | FISH，NGS | 诊断C11orf95融合阳性型幕上室管膜的特异性标志物 | 发生该融合的幕上室管膜瘤患者预后相对较差 |
YAP1 | 基因融合(YAP1-MAMLD1) | FISH，NGS | 诊断YAP1融合阳性型幕上室管膜的特异性标志物 | 发生该融合的幕上室管膜瘤患者预后相对较好 |
MYCN | 扩增 | FISH，NGS | 诊断MYCN扩增型脊髓室管膜的特异性标志物 | 发生该扩增的脊髓室管膜瘤患者预后相对较差 |
NF1 | 突变 | Sanger测序，NGS | 在视路胶质瘤和IDH野生型胶质母细胞瘤中突变频率较高 | 携带该突变的毛细胞型星形细胞瘤预后相对较好 |
如何做胶质瘤分子检测？
做分子病理检测需要提供的样本主要是患者的病理组织，可以是蜡块、切成的白片或者新鲜组织。部分项目的检测方式需要患者的血液样本，具体根据检测项目来定。要注意：肿瘤组织是较佳样本，可以说是金标准。
选择检测机构的注意事项
患者在选择基因检测机构时，需要注意实验室资质——需获得国家（国际）认可，即双“C”认证。CAP（College of American Pathologists，美国病理学家协会）是专由临床检验学家和病理学家组成的联合会，被广泛公认为是实验室质量确定的重要成员之一。CAP认证是通过对临床实验室各个学科全方面制定详细的检查单并严格要求来确保实验室符合质量标准，从而改进实验室的实际工作，确保病人检测结果的准确性。因此，拥有双CAP+CLIA双重认证的实验室，那必定靠谱。因此大家在选择基因检测公司的时候尽量选择双“C”认证的公司。
资料来源：国家卫生健康委员会医政医管局,中国抗癌协会脑胶质瘤委员会,中国医师协会脑胶质瘤委员会.脑胶质瘤咨询指南（2022版）[J].中华神经外科杂志,2022,38(08):757-777.DOI:10.3760/cma.j.cn112050-20220510-00239