中国发布基因编辑动物突变数据库VDGE，填补领域空白

中国发布基因编辑动物突变数据库VDGE，填补领域空白

引用

中国科学院

等

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来源

1.

http://www.kmb.cas.cn/kyjz/202411/t20241101_7415862.html

2.

https://blog.csdn.net/qq_48764574/article/details/138356916

3.

https://www.gelonghui.com/p/1647293

4.

https://news.sciencenet.cn/htmlpaper/2024/11/20241112165627901123773.shtm

5.

https://www.cas.cn/syky/202411/t20241106_5038732.shtml

6.

http://www.ioz.cas.cn/gb2018/xwdt/kyjz/202410/t20241009_7394857.html

7.

https://news.sciencenet.cn/htmlpaper/2025/1/202512113501743127447.shtm

8.

https://www.stdaily.com/web/gjxw/2025-01/13/content_284889.html

9.

https://kw.beijing.gov.cn/xwdt/kcyx/xwdtkjqy/202411/t20241118_3944756.html

10.

https://www.akesobio.com/cn/media/akeso-news/20240601/

11.

https://vegremotesensing.com/2024/12/29/shap%E5%8F%AF%E8%A7%A3%E9%87%8A%E6%9C%BA%E5%99%A8%E5%AD%A6%E4%B9%A0%E6%8F%AD%E7%A4%BA%E5%85%A8%E7%90%83%E6%A4%8D%E8%A2%AB%E7%94%9F%E4%BA%A7%E5%8A%9B%E6%B8%A9%E5%BA%A6%E9%99%90%E5%88%B6%E7%BC%93/

12.

https://www.cnblogs.com/gisrs365/articles/18332521

13.

https://m.chyxx.com/industry/1180521.html

14.

https://vegremotesensing.com/2024/11/06/%E8%AF%BE%E9%A2%98%E7%BB%84%E9%A1%BA%E5%88%A9%E5%AE%8C%E6%88%90%E4%BA%91%E5%8D%97%E9%87%8E%E5%A4%96%E7%A7%91%E5%AD%A6%E8%80%83%E5%AF%9F/

15.

https://www.vivo.com.cn/vivo/iqooz5x/

近日，中国科学院研究团队发布了一项重要科研成果——基因编辑动物新发突变数据库VDGE。这一数据库的上线，为基因编辑动物研究提供了重要的数据资源平台，有望推动生物科学、医学及农业领域的发展。

基因编辑技术是近年来生物科学领域的重要突破，通过精确修改动物基因组，可以创造出具有特定遗传特征的动物模型。这些基因编辑动物在疾病研究、药物开发、农业生产等领域展现出巨大的应用潜力。然而，随着基因编辑动物数量的快速增长，如何系统地收集和整理这些动物的遗传变异数据，成为了一个亟待解决的问题。

为了解决这一难题，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）赵文明团队、昆明动物研究所王国栋研究组、遗传与发育生物学研究所张永清研究组联合开发了VDGE数据库。该数据库具有以下显著特点：

1. 数据全面性：目前收录了恒河猴、食蟹猴和犬等多个物种的基因编辑动物数据，涵盖了107个动物家系、174个全基因组测序样本、56个目标突变、115,710个变异及12,708个相关基因。

2. 标准化分析：实现了对基因编辑动物新发突变的标准化分析，确保数据的准确性和一致性。

3. 模块化设计：数据库包括物种、家系、样本、目标突变、变异和相关基因6个关键模块，方便用户根据需求进行数据检索和分析。

4. 开放性：不仅整合了具有全基因组测序数据的动物信息，还收录了部分缺乏测序数据的基因编辑猪和犬的相关信息。

这一数据库的发布具有重要意义：

1. 推动科学研究：为基因编辑动物研究提供了重要的数据资源，有助于科学家深入理解基因编辑带来的遗传变异。

2. 促进技术发展：通过标准化的数据分析和展示，可以加速基因编辑技术的优化和改进。

3. 跨学科应用：不仅在基础科学研究中发挥作用，还为医学研究和农业生产提供了有力支持。

4. 国际影响力：研究成果发表在国际知名期刊Nucleic Acids Research上，体现了中国在基因编辑领域的科研实力。

未来，VDGE数据库将进一步整合更多物种的基因编辑数据，不断丰富数据类型，为全球科研人员提供更全面、更便捷的数据资源平台。这一创新成果不仅展示了中国在生物信息学领域的技术实力，更为全球基因编辑研究开辟了新的篇章。