SCI投稿，一定要提交原始数据吗？
SCI投稿，一定要提交原始数据吗？
近年来，越来越多的SCI期刊开始严格要求作者在审稿或修稿阶段提交原始数据，特别是生物医学研究中的Western blot数据。这种变化源于学术界对科研诚信和数据完整性的高度重视。本文将详细探讨这一趋势背后的原因，并提供具体的Western blot数据处理和展示规范。
在学术论文写作中，引用有针对性的实验数据是不可避免的。实验数据的质量直接影响着我们文章的水平和层次。因此，选择科学、真实可靠、严谨的数据对于学术论文写作至关重要。
近年来，小鹿在投稿基础生物医学研究论文时发现，越来越多的SCI期刊（如PLoS One、Neuroscience等权威期刊）要求在审稿或修稿阶段提交原始数据，尤其是Western blot。然而，仍有少数期刊不主动要求作者提供原始数据，因为这涉及到作者的著作权等相关问题。不过，在特殊情况下，如果审稿编辑或外审专家对文章中的数据提出质疑或疑问，他们会强烈要求作者提交与该论文相关的所有原始数据，包括但不限于原始数据、数据处理过程以及所使用处理软件的序列号等详细信息。这些要求非常严格，否则文章可能面临被撤稿的风险。
在科学论文中，当作者投稿新论文时，他们可以通过投稿系统上传原始数据。作者通常不必担心数据泄露或被盗用，因为大型期刊出版社（如Springer、Wiley、Frontiers、Elsevier）会严格保密和保管作者提交的原始数据。因此，大家可以放心。
为什么近几年SCI期刊刊登生物医学论文时对数据进行严格把关呢？
据《分子大脑》(Molecular Brain)期刊的一位编者，即日本藤田保健卫生大学遗传学教授Tsuyoshi Miyakawa博士透露，若期刊未能强制要求作者公开研究数据，可能导致无法复制研究的“严重困境”，进而妨碍揭露科研欺诈的可能性。他在审核过程中，注意到部分论文呈现“出乎意料的优异结果”，因此主动向作者索取原始数据。
在2017年初至2019年9月期间，他针对180篇论文中的41篇疑似存在问题的论文提出了数据请求。其中，超过半数，即21篇论文因未能提供数据而被撤回；剩下的20篇论文中，有19篇提供的数据不足以支持其结论。在这19篇论文中，有7篇的原始数据与论文陈述的结果不符；另外，他还发现其中有2篇论文存在图像重复和不恰当的图像编辑痕迹。
早在2016年，关于生物医学论文中使用异常和不规范的Western blot和显微图片的事件引起了学术界知名学者们的关注。这一问题得到了国际大型学术出版社的重视，因此越来越多的出版社开始认真对待该问题，并对每篇接收的文章进行严格的图片检测。
我们一起来看看Monya Baker于2016年4月22日在Nature上发布的文章“Problematic images found in 4% of biomedical papers”。
Monya Baker在文中引用了一位Elisabeth Bik在bioRxiv发布的文章“The Prevalence of Inappropriate Image Duplication in Biomedical Research Publications”。
在历时两年的深入调查中，Elisabeth Bik专注于对1995年至2014年间发表于40种专业生物医学期刊的共计20,621篇学术论文进行了详尽的筛查。其研究揭示了一个令人不安的现象：平均每25篇论文中就有一篇存在图片不当使用的状况，具体表现为重复使用显微图像、镜像反转或对照片部分区域进行裁剪。
Elisabeth Bik也在另一篇2019年发表在PLoS One的文章上，其中两张图的细胞学显微照片中竟然找出多个重复区域（见下图），于是该文章被撤稿。
来源: S. Geng et al. PLoS ONE 9, e91566 (2014); retraction 14, e0214018 (2019).
除此之外，Elisabeth Bik也在另一篇2019年发表在PLoS One的文章上发现4张图的Western blot图片存在可疑的重复问题，于是该文章被撤稿。
来源：Y. Tan et al. PLoS ONE 9, e102195 (2014); retraction 14, e0220600 (2019).
我们再引用一个案例，Elisabeth Bik在2019年发表的一篇同行评审文章中，同样因发现免疫印迹图存在瑕疵，导致该文被撤回。
来源：A. Kawiak et al. PLoS ONE 11, e0164064 (2016); retraction 14, e0207273 (2019).
此外，2013年，意大利的BioDigitalValley生物医学服务和信息咨询公司的负责人Enrico Bucci向《Nature》杂志透露了一项发现。他在一篇由意大利科学家撰写的论文中发现了异常的图片，例如在凝胶电泳条带上发现了剪切和粘贴的缺口。因此，该论文被撤稿。
在被要求提供Western blot的原图时，大多数出版社要求作者提供未经处理且带有分子量marker条带的原图，即通过转膜后使用照相机拍摄的照片。下面的图例展示了一个出版社可接受的例子。
在电泳完成后，常常需要将凝胶上与感兴趣的目标蛋白无关的部分切除，以便只展示感兴趣的目标蛋白。在某些情况下，可以在转膜和染色后剪接PVDF膜本身，并进行特异性抗体的孵育，以减少实验所需试剂的使用。然而，一旦凝胶被切割，就无法再次接合，只有图像可以被随意裁剪。以下是出版社可接受的Western Blot图像拼接的示例，其中已经裁剪并展示了Western Blot图像的与目标蛋白无关的部分，以便读者清晰地看到拼接结果：
以下也是一个可接受的Western Blot裁剪的例子，其中膜本身已经被剪切（原始、未经编辑处理的）:
在进行Western blot检测时，如果发现图像经过不恰当的编辑，比如某一条泳道被裁剪并粘贴到图像的其他区域，这样会导致图像缺乏完整性。因此，为了确保数据的准确性和可靠性，最佳的做法是保存最原始的、未经编辑的、最初捕获的图像文件，并且要妥善记录实验过程。此外，还要确保裁剪过的Western blot图像不被篡改或进行不必要的编辑。
下面是不被期刊接受的Western blot原图裁剪的例子，这明显是被拼接过的。
在学术论文的整个出版过程中，凝胶和Western Blot图像的裁剪是一种常见的做法。在许多情况下，对图像进行水平和垂直裁剪是可以接受的。然而，作者在进行裁剪或编辑时必须小心，并确保不会损害这些图像所显示的数据的科学完整性。
在此，知云再次提醒，完成实验后，请妥善保存数据和记录。不仅仅是要保存Western blot的原图，还要保管显微照片、PCR数据等。特别是DNA和RNA序列的信息，在投稿后最好上传到网络服务器并公开，以备将来使用。