图神经网络（GNN）的不同变种及其应用

图神经网络（GNN）的不同变种及其应用

引用

CSDN

1.

https://blog.csdn.net/fengdu78/article/details/115912242

图神经网络（Graph Neural Network，GNN）是一种专门用于处理图结构数据的神经网络模型。它能够有效地捕捉节点之间的关系和结构信息，在推荐系统、社交网络分析、分子性质预测等领域有着广泛的应用。本文将详细介绍GNN的不同变种及其应用场景。

图神经网络（GNN）

图神经网络（Graph Neural Network，GNN）最早由 Scarselli 等人提出。图中的一个节点可以通过其特征和相关节点进行定义，GNN 的目标是学习一个状态嵌入用于表示每个节点的邻居信息。状态嵌入可以生成输出向量用于作为预测节点标签的分布等。

下面三张图分别从图的类型，训练方法和传播过程角度列举了不同 GNN 的变种。

为了根据邻居更新节点的状态，定义一个用于所有节点的函数，称之为local transition function。定义一个函数，用于生成节点的输出，称之为local output function。有：

其中，表示输入特征，表示隐含状态。为连接到节点的边集，为节点的邻居。

令和分别表示状态、输出、特征和所有节点特征的向量，有：

其中，为global transition function，为global output function，分别为图中所有节点的 local transition function和 local output function的堆叠版本。依据 Banach 的 Fixed Point Theorem，GNN 利用传统的迭代方式计算状态：

其中，表示第论循环的值。

介绍完 GNN 的框架后，下一个问题就是如果学习得到 local transition function和 local output function。在包含目标信息（对于特定节点）的监督学习情况下，损失为：

其中，为用于监督学习的节点数量。利用基于梯度下降的学习方法优化模型后，我们可以得到针对特定任务的训练模型和图中节点的隐含状态。

尽管实验结果表明 GNN 是一个用于建模结构数据的强大模型，但对于一般的 GNN 模型仍存在如下缺陷：

1. 对于固定点，隐含状态的更新是低效地。
2. GNN 在每一轮计算中共享参数，而常见的神经网络结构在不同层使用不同的参数。同时，隐含节点状态的更新可以进一步应用 RNN 的思想。
3. 边上的一些信息特征并没有被有效的建模，同时如何学习边的隐含状态也是一个重要问题。
4. 如果我们更关注节点的表示而非图的表示，当迭代轮数很大时使用固定点是不合适的。这是因为固定点表示的分布在数值上会更加平滑，从而缺少用于区分不同节点的信息。

图卷积神经网络（GCN）

图卷积神经网络是将用于传统数据（例如：图像）的卷积操作应用到图结构的数据中。核心思想在于学习一个函数，通过聚合节点自身的特征和邻居的特征获得节点的表示，其中为节点的邻居。

下图展示了一个用于节点表示学习的 GCN 过程：

GCN 在构建更复杂的图神经网路中扮演了一个核心角色：

• 包含 Pooling 模块用于图分类的 GCN
• 包含 GCN 的图自编码器
• 包含 GCN 的图时空网络

GCN 方法可以分为两大类：基于频谱（Spectral Methods）和基于空间（Spatial Methods）的方法。

基于频谱的方法（Spectral Methods）

基于频谱的方法将图视为无向图进行处理，图的一种鲁棒的数学表示为标准化的图拉普拉斯矩阵：

其中，为图的邻接矩阵，为节点度的对角矩阵，。标准化的拉普拉斯矩阵具有实对称半正定的性质，因此可以分解为：

其中，是由的特征向量构成的矩阵，为特征值的对角矩阵，。在图信号处理过程中，一个图信号是一个由图的节点构成的特征向量，其中表示第个节点的值。对于信号，图上的傅里叶变换可以定义为：

傅里叶反变换定义为：

其中，为傅里叶变换后的结果。

转变后信号的元素为新空间图信号的坐标，因此输入信号可以表示为：

这正是傅里叶反变换的结果。那么对于输入信号的图卷积可以定义为：

其中，为滤波器，表示逐元素乘。假设定义一个滤波器，则图卷积可以简写为：

基于频谱的图卷积网络都遵循这样的定义，不同之处在于不同滤波器的选择。

基于空间的方法（Spatial Methods）

基于空间的方法通过节点的空间关系来定义图卷积操作。为了将图像和图关联起来，可以将图像视为一个特殊形式的图，每个像素点表示一个节点，如下图所示：

每个像素同周围的像素相连，以为窗口，每个节点被 8 个邻居节点所包围。通过对中心节点和周围邻居节点的像素值进行加权平均来应用一个大小的滤波器。由于邻居节点的特定顺序，可以在不同位置共享权重。同样对于一般的图，基于空间的图卷积通过对中心和邻居节点的聚合得到节点新的表示。

为了使节点可以感知更深和更广的范围，通常的做法是将多个图卷积层堆叠在一起。根据堆叠方式的不同，基于空间的图卷积可以进一步分为两类：基于循环（Recurrent-based）和基于组合（Composition-based）的。基于循环的方法使用相同的图卷积层来更新隐含表示，基于组合的方式使用不同的图卷积层更新隐含表示，两者差异如下图所示：

图循环神经网络（GRN）

一些研究尝试利用门控机制（例如：GRU 或 LSTM）用于减少之前 GNN 模型在传播过程中的限制，同时改善在图结构中信息的长距离传播。GGNN 提出了一种使用 GRU 进行传播的方法。它将 RNN 展开至一个固定步，然后通过基于时间的传导计算梯度。传播模型的基础循环方式如下：

节点首先从邻居汇总信息，其中为图邻接矩阵的子矩阵表示节点及其邻居的连接。类似 GRU 的更新函数，通过结合其他节点和上一时间的信息更新节点的隐状态。用于获取节点邻居的信息，和分别为更新和重置门。

GGNN 模型设计用于解决序列生成问题，而之前的模型主要关注单个输出，例如：节点级别或图级别的分类问题。研究进一步提出了 Gated Graph Sequence Neural Networks（GGS-NNs），使用多个 GGNN 产生一个输出序列，如下图所示：

上图中使用了两个 GGNN，用于从预测，用于从预测。令表示第步输出的第步传播，在任意步初始化为，在任意步初始化为，和可以为不同模型也可以共享权重。

图注意力网络（GAT）

与 GCN 对于节点所有的邻居平等对待相比，注意力机制可以为每个邻居分配不同的注意力评分，从而识别更重要的邻居。

GAT 将注意力机制引入传播过程，其遵循自注意力机制，通过对每个节点邻居的不同关注更新隐含状态。GAT 定义了一个图注意力层（graph attentional layer），通过堆叠构建图注意力网络。对于节点对，基于注意力机制的系数计算方式如下：

其中，表示节点对的注意力系数，表示节点的邻居。令 表示输入节点特征，其中为节点的数量，为特征维度，则节点的输出特征（可能为不同维度）为 。为所有节点共享的线性变换的权重矩阵，用于计算注意力系数。最后的输出特征计算方式如下：

注意力层采用多头注意力机制来稳定学习过程，之后应用个独立的注意力机制计算隐含状态，最后通过拼接或平均得到输出表示：

其中，表示连接操作，表示第个注意力机制计算得到的标准化的注意力系数。整个模型如下图所示：

GAT 中的注意力架构有如下几个特点：

1. 针对节点对的计算是并行的，因此计算过程是高效的。
2. 可以处理不同度的节点并对邻居分配对应的权重。
3. 可以容易地应用到归纳学习问题中去。

应用

图神经网络已经被应用在监督、半监督、无监督和强化学习等多个领域。下图列举了 GNN 在不同领域内相关问题中的应用，具体模型论文请参考 Graph Neural Networks: A Review of Methods and Applications。